Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP8

GBP5, Guanylate-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP5Q96PP8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GBP5Q96PP8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GBP5Q96PP8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GBP5Q96PP8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GBP5Q96PP8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GBP5Q96PP8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GBP5Q96PP8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GBP5Q96PP8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GBP5Q96PP8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GBP5Q96PP8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GBP5Q96PP8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GBP5Q96PP8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GBP5Q96PP8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GBP5Q96PP8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GBP5Q96PP8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GBP5Q96PP8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GBP5Q96PP8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GBP5Q96PP8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GBP5Q96PP8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GBP5Q96PP8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GBP5Q96PP8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GBP5Q96PP8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GBP5Q96PP8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GBP5Q96PP8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GBP5Q96PP8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GBP5Q96PP8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GBP5Q96PP8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GBP5Q96PP8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GBP5Q96PP8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GBP5Q96PP8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GBP5Q96PP8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GBP5Q96PP8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GBP5Q96PP8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GBP5Q96PP8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GBP5Q96PP8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GBP5Q96PP8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GBP5Q96PP8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GBP5Q96PP8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GBP5Q96PP8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GBP5Q96PP8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GBP5Q96PP8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GBP5Q96PP8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GBP5Q96PP8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GBP5Q96PP8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GBP5Q96PP8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GBP5Q96PP8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GBP5Q96PP8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GBP5Q96PP8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GBP5Q96PP8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GBP5Q96PP8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GBP5Q96PP8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GBP5Q96PP8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GBP5Q96PP8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GBP5Q96PP8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GBP5Q96PP8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GBP5Q96PP8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GBP5Q96PP8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GBP5Q96PP8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GBP5Q96PP8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GBP5Q96PP8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GBP5Q96PP8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GBP5Q96PP8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GBP5Q96PP8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
GBP5Q96PP8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GBP5Q96PP8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GBP5Q96PP8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GBP5Q96PP8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GBP5Q96PP8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GBP5Q96PP8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GBP5Q96PP8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GBP5Q96PP8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GBP5Q96PP8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GBP5Q96PP8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GBP5Q96PP8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GBP5Q96PP8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GBP5Q96PP8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GBP5Q96PP8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GBP5Q96PP8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GBP5Q96PP8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GBP5Q96PP8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GBP5Q96PP8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GBP5Q96PP8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GBP5Q96PP8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GBP5Q96PP8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GBP5Q96PP8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GBP5Q96PP8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GBP5Q96PP8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GBP5Q96PP8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GBP5Q96PP8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GBP5Q96PP8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GBP5Q96PP8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GBP5Q96PP8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GBP5Q96PP8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GBP5Q96PP8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GBP5Q96PP8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GBP5Q96PP8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GBP5Q96PP8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GBP5Q96PP8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GBP5Q96PP8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GBP5Q96PP8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms