Protein–RNA interactions for Protein: Q96ME1

FBXL18, F-box/LRR-repeat protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL18Q96ME1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FBXL18Q96ME1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FBXL18Q96ME1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FBXL18Q96ME1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FBXL18Q96ME1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FBXL18Q96ME1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
FBXL18Q96ME1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
FBXL18Q96ME1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
FBXL18Q96ME1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
FBXL18Q96ME1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FBXL18Q96ME1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FBXL18Q96ME1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
FBXL18Q96ME1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FBXL18Q96ME1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FBXL18Q96ME1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FBXL18Q96ME1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FBXL18Q96ME1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FBXL18Q96ME1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
FBXL18Q96ME1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FBXL18Q96ME1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FBXL18Q96ME1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FBXL18Q96ME1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FBXL18Q96ME1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FBXL18Q96ME1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FBXL18Q96ME1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FBXL18Q96ME1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FBXL18Q96ME1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FBXL18Q96ME1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FBXL18Q96ME1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
FBXL18Q96ME1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
FBXL18Q96ME1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FBXL18Q96ME1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FBXL18Q96ME1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FBXL18Q96ME1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
FBXL18Q96ME1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FBXL18Q96ME1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FBXL18Q96ME1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FBXL18Q96ME1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FBXL18Q96ME1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FBXL18Q96ME1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FBXL18Q96ME1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FBXL18Q96ME1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FBXL18Q96ME1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FBXL18Q96ME1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FBXL18Q96ME1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FBXL18Q96ME1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FBXL18Q96ME1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FBXL18Q96ME1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FBXL18Q96ME1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FBXL18Q96ME1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FBXL18Q96ME1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FBXL18Q96ME1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FBXL18Q96ME1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FBXL18Q96ME1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FBXL18Q96ME1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FBXL18Q96ME1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FBXL18Q96ME1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FBXL18Q96ME1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FBXL18Q96ME1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FBXL18Q96ME1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FBXL18Q96ME1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FBXL18Q96ME1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FBXL18Q96ME1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
FBXL18Q96ME1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FBXL18Q96ME1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FBXL18Q96ME1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FBXL18Q96ME1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FBXL18Q96ME1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FBXL18Q96ME1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FBXL18Q96ME1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FBXL18Q96ME1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FBXL18Q96ME1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FBXL18Q96ME1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FBXL18Q96ME1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FBXL18Q96ME1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FBXL18Q96ME1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FBXL18Q96ME1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FBXL18Q96ME1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FBXL18Q96ME1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FBXL18Q96ME1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FBXL18Q96ME1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
FBXL18Q96ME1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
FBXL18Q96ME1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
FBXL18Q96ME1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FBXL18Q96ME1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FBXL18Q96ME1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FBXL18Q96ME1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
FBXL18Q96ME1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
FBXL18Q96ME1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
FBXL18Q96ME1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
FBXL18Q96ME1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
FBXL18Q96ME1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
FBXL18Q96ME1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
FBXL18Q96ME1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
FBXL18Q96ME1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
FBXL18Q96ME1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FBXL18Q96ME1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FBXL18Q96ME1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FBXL18Q96ME1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FBXL18Q96ME1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116 ms