Protein–RNA interactions for Protein: Q96ME1

FBXL18, F-box/LRR-repeat protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL18Q96ME1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FBXL18Q96ME1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FBXL18Q96ME1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FBXL18Q96ME1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FBXL18Q96ME1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FBXL18Q96ME1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
FBXL18Q96ME1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
FBXL18Q96ME1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
FBXL18Q96ME1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
FBXL18Q96ME1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FBXL18Q96ME1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FBXL18Q96ME1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
FBXL18Q96ME1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FBXL18Q96ME1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FBXL18Q96ME1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FBXL18Q96ME1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FBXL18Q96ME1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FBXL18Q96ME1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
FBXL18Q96ME1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FBXL18Q96ME1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FBXL18Q96ME1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FBXL18Q96ME1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FBXL18Q96ME1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FBXL18Q96ME1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FBXL18Q96ME1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FBXL18Q96ME1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FBXL18Q96ME1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FBXL18Q96ME1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FBXL18Q96ME1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
FBXL18Q96ME1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
FBXL18Q96ME1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FBXL18Q96ME1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FBXL18Q96ME1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FBXL18Q96ME1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
FBXL18Q96ME1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FBXL18Q96ME1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FBXL18Q96ME1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FBXL18Q96ME1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FBXL18Q96ME1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FBXL18Q96ME1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FBXL18Q96ME1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FBXL18Q96ME1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FBXL18Q96ME1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FBXL18Q96ME1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FBXL18Q96ME1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FBXL18Q96ME1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FBXL18Q96ME1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FBXL18Q96ME1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FBXL18Q96ME1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FBXL18Q96ME1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FBXL18Q96ME1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FBXL18Q96ME1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FBXL18Q96ME1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FBXL18Q96ME1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FBXL18Q96ME1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FBXL18Q96ME1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FBXL18Q96ME1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FBXL18Q96ME1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FBXL18Q96ME1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FBXL18Q96ME1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FBXL18Q96ME1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FBXL18Q96ME1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FBXL18Q96ME1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
FBXL18Q96ME1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FBXL18Q96ME1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FBXL18Q96ME1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FBXL18Q96ME1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FBXL18Q96ME1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FBXL18Q96ME1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FBXL18Q96ME1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FBXL18Q96ME1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FBXL18Q96ME1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FBXL18Q96ME1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FBXL18Q96ME1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FBXL18Q96ME1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FBXL18Q96ME1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FBXL18Q96ME1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FBXL18Q96ME1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FBXL18Q96ME1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FBXL18Q96ME1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FBXL18Q96ME1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
FBXL18Q96ME1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
FBXL18Q96ME1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
FBXL18Q96ME1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FBXL18Q96ME1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FBXL18Q96ME1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FBXL18Q96ME1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
FBXL18Q96ME1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
FBXL18Q96ME1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
FBXL18Q96ME1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
FBXL18Q96ME1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
FBXL18Q96ME1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
FBXL18Q96ME1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
FBXL18Q96ME1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
FBXL18Q96ME1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
FBXL18Q96ME1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FBXL18Q96ME1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FBXL18Q96ME1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FBXL18Q96ME1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FBXL18Q96ME1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms