Protein–RNA interactions for Protein: Q96LW4

PRIMPOL, DNA-directed primase/polymerase protein, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIMPOLQ96LW4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRIMPOLQ96LW4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRIMPOLQ96LW4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PRIMPOLQ96LW4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PRIMPOLQ96LW4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PRIMPOLQ96LW4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PRIMPOLQ96LW4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
PRIMPOLQ96LW4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PRIMPOLQ96LW4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRIMPOLQ96LW4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRIMPOLQ96LW4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRIMPOLQ96LW4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRIMPOLQ96LW4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRIMPOLQ96LW4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRIMPOLQ96LW4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRIMPOLQ96LW4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRIMPOLQ96LW4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRIMPOLQ96LW4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRIMPOLQ96LW4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRIMPOLQ96LW4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRIMPOLQ96LW4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRIMPOLQ96LW4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRIMPOLQ96LW4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRIMPOLQ96LW4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRIMPOLQ96LW4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRIMPOLQ96LW4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRIMPOLQ96LW4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRIMPOLQ96LW4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRIMPOLQ96LW4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRIMPOLQ96LW4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRIMPOLQ96LW4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRIMPOLQ96LW4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PRIMPOLQ96LW4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRIMPOLQ96LW4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRIMPOLQ96LW4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRIMPOLQ96LW4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRIMPOLQ96LW4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRIMPOLQ96LW4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRIMPOLQ96LW4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRIMPOLQ96LW4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRIMPOLQ96LW4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRIMPOLQ96LW4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRIMPOLQ96LW4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRIMPOLQ96LW4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRIMPOLQ96LW4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRIMPOLQ96LW4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRIMPOLQ96LW4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRIMPOLQ96LW4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRIMPOLQ96LW4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRIMPOLQ96LW4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PRIMPOLQ96LW4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRIMPOLQ96LW4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRIMPOLQ96LW4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRIMPOLQ96LW4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRIMPOLQ96LW4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRIMPOLQ96LW4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRIMPOLQ96LW4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRIMPOLQ96LW4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRIMPOLQ96LW4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRIMPOLQ96LW4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRIMPOLQ96LW4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRIMPOLQ96LW4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRIMPOLQ96LW4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
PRIMPOLQ96LW4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRIMPOLQ96LW4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRIMPOLQ96LW4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
PRIMPOLQ96LW4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRIMPOLQ96LW4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRIMPOLQ96LW4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRIMPOLQ96LW4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRIMPOLQ96LW4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRIMPOLQ96LW4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRIMPOLQ96LW4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRIMPOLQ96LW4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRIMPOLQ96LW4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRIMPOLQ96LW4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
PRIMPOLQ96LW4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRIMPOLQ96LW4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRIMPOLQ96LW4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRIMPOLQ96LW4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRIMPOLQ96LW4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRIMPOLQ96LW4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRIMPOLQ96LW4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRIMPOLQ96LW4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRIMPOLQ96LW4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRIMPOLQ96LW4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRIMPOLQ96LW4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRIMPOLQ96LW4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRIMPOLQ96LW4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRIMPOLQ96LW4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRIMPOLQ96LW4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRIMPOLQ96LW4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRIMPOLQ96LW4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRIMPOLQ96LW4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRIMPOLQ96LW4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRIMPOLQ96LW4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRIMPOLQ96LW4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRIMPOLQ96LW4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRIMPOLQ96LW4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
PRIMPOLQ96LW4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms