Protein–RNA interactions for Protein: Q96FV0

LRRC46, Leucine-rich repeat-containing protein 46, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC46Q96FV0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC46Q96FV0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC46Q96FV0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC46Q96FV0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC46Q96FV0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC46Q96FV0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC46Q96FV0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRC46Q96FV0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRC46Q96FV0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC46Q96FV0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC46Q96FV0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC46Q96FV0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC46Q96FV0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC46Q96FV0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC46Q96FV0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC46Q96FV0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC46Q96FV0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC46Q96FV0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC46Q96FV0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC46Q96FV0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC46Q96FV0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC46Q96FV0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC46Q96FV0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC46Q96FV0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC46Q96FV0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC46Q96FV0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC46Q96FV0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC46Q96FV0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC46Q96FV0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC46Q96FV0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC46Q96FV0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC46Q96FV0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC46Q96FV0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC46Q96FV0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC46Q96FV0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC46Q96FV0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC46Q96FV0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC46Q96FV0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC46Q96FV0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC46Q96FV0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC46Q96FV0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC46Q96FV0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC46Q96FV0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC46Q96FV0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC46Q96FV0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC46Q96FV0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC46Q96FV0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC46Q96FV0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC46Q96FV0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC46Q96FV0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC46Q96FV0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC46Q96FV0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC46Q96FV0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC46Q96FV0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC46Q96FV0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC46Q96FV0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC46Q96FV0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC46Q96FV0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC46Q96FV0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC46Q96FV0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC46Q96FV0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC46Q96FV0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC46Q96FV0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC46Q96FV0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC46Q96FV0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC46Q96FV0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC46Q96FV0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC46Q96FV0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC46Q96FV0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC46Q96FV0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC46Q96FV0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC46Q96FV0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC46Q96FV0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC46Q96FV0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC46Q96FV0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC46Q96FV0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC46Q96FV0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC46Q96FV0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC46Q96FV0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC46Q96FV0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC46Q96FV0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC46Q96FV0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC46Q96FV0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC46Q96FV0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC46Q96FV0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC46Q96FV0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC46Q96FV0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC46Q96FV0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC46Q96FV0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC46Q96FV0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC46Q96FV0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC46Q96FV0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC46Q96FV0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC46Q96FV0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC46Q96FV0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC46Q96FV0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC46Q96FV0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC46Q96FV0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC46Q96FV0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC46Q96FV0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms