Protein–RNA interactions for Protein: Q96ER9

CCDC51, Coiled-coil domain-containing protein 51, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC51Q96ER9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC51Q96ER9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC51Q96ER9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC51Q96ER9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC51Q96ER9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC51Q96ER9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC51Q96ER9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC51Q96ER9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC51Q96ER9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC51Q96ER9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC51Q96ER9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC51Q96ER9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC51Q96ER9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC51Q96ER9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
CCDC51Q96ER9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC51Q96ER9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC51Q96ER9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC51Q96ER9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC51Q96ER9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC51Q96ER9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC51Q96ER9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC51Q96ER9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC51Q96ER9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC51Q96ER9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC51Q96ER9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC51Q96ER9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC51Q96ER9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC51Q96ER9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC51Q96ER9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC51Q96ER9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC51Q96ER9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC51Q96ER9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC51Q96ER9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC51Q96ER9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC51Q96ER9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC51Q96ER9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC51Q96ER9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC51Q96ER9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC51Q96ER9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC51Q96ER9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC51Q96ER9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC51Q96ER9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC51Q96ER9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC51Q96ER9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC51Q96ER9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC51Q96ER9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC51Q96ER9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC51Q96ER9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC51Q96ER9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC51Q96ER9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC51Q96ER9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC51Q96ER9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC51Q96ER9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC51Q96ER9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC51Q96ER9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC51Q96ER9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC51Q96ER9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC51Q96ER9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC51Q96ER9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC51Q96ER9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC51Q96ER9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC51Q96ER9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC51Q96ER9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC51Q96ER9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC51Q96ER9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC51Q96ER9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC51Q96ER9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC51Q96ER9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC51Q96ER9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC51Q96ER9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC51Q96ER9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC51Q96ER9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC51Q96ER9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC51Q96ER9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC51Q96ER9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC51Q96ER9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC51Q96ER9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC51Q96ER9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC51Q96ER9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC51Q96ER9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC51Q96ER9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC51Q96ER9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC51Q96ER9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC51Q96ER9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC51Q96ER9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC51Q96ER9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC51Q96ER9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC51Q96ER9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC51Q96ER9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC51Q96ER9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC51Q96ER9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC51Q96ER9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC51Q96ER9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC51Q96ER9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC51Q96ER9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC51Q96ER9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC51Q96ER9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC51Q96ER9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC51Q96ER9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC51Q96ER9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms