Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCG3Q8WXD2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCG3Q8WXD2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCG3Q8WXD2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCG3Q8WXD2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCG3Q8WXD2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCG3Q8WXD2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCG3Q8WXD2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SCG3Q8WXD2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCG3Q8WXD2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SCG3Q8WXD2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SCG3Q8WXD2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SCG3Q8WXD2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCG3Q8WXD2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCG3Q8WXD2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCG3Q8WXD2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCG3Q8WXD2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCG3Q8WXD2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCG3Q8WXD2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCG3Q8WXD2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCG3Q8WXD2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCG3Q8WXD2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCG3Q8WXD2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCG3Q8WXD2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SCG3Q8WXD2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SCG3Q8WXD2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SCG3Q8WXD2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCG3Q8WXD2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCG3Q8WXD2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCG3Q8WXD2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCG3Q8WXD2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCG3Q8WXD2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCG3Q8WXD2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCG3Q8WXD2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCG3Q8WXD2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SCG3Q8WXD2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCG3Q8WXD2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCG3Q8WXD2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCG3Q8WXD2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCG3Q8WXD2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCG3Q8WXD2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCG3Q8WXD2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCG3Q8WXD2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCG3Q8WXD2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCG3Q8WXD2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SCG3Q8WXD2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SCG3Q8WXD2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SCG3Q8WXD2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SCG3Q8WXD2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SCG3Q8WXD2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SCG3Q8WXD2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SCG3Q8WXD2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SCG3Q8WXD2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SCG3Q8WXD2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCG3Q8WXD2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCG3Q8WXD2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SCG3Q8WXD2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCG3Q8WXD2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCG3Q8WXD2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCG3Q8WXD2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCG3Q8WXD2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCG3Q8WXD2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCG3Q8WXD2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SCG3Q8WXD2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCG3Q8WXD2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCG3Q8WXD2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCG3Q8WXD2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCG3Q8WXD2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCG3Q8WXD2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCG3Q8WXD2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCG3Q8WXD2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCG3Q8WXD2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCG3Q8WXD2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCG3Q8WXD2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCG3Q8WXD2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCG3Q8WXD2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCG3Q8WXD2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCG3Q8WXD2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SCG3Q8WXD2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCG3Q8WXD2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCG3Q8WXD2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SCG3Q8WXD2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCG3Q8WXD2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SCG3Q8WXD2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SCG3Q8WXD2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SCG3Q8WXD2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCG3Q8WXD2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCG3Q8WXD2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCG3Q8WXD2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCG3Q8WXD2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCG3Q8WXD2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCG3Q8WXD2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SCG3Q8WXD2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SCG3Q8WXD2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SCG3Q8WXD2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCG3Q8WXD2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCG3Q8WXD2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCG3Q8WXD2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCG3Q8WXD2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCG3Q8WXD2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms