Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWT9

SLC13A3, Solute carrier family 13 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A3Q8WWT9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC13A3Q8WWT9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC13A3Q8WWT9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC13A3Q8WWT9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC13A3Q8WWT9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC13A3Q8WWT9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC13A3Q8WWT9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC13A3Q8WWT9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC13A3Q8WWT9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC13A3Q8WWT9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC13A3Q8WWT9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC13A3Q8WWT9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC13A3Q8WWT9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC13A3Q8WWT9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC13A3Q8WWT9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC13A3Q8WWT9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC13A3Q8WWT9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC13A3Q8WWT9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC13A3Q8WWT9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC13A3Q8WWT9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC13A3Q8WWT9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC13A3Q8WWT9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC13A3Q8WWT9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC13A3Q8WWT9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC13A3Q8WWT9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC13A3Q8WWT9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC13A3Q8WWT9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC13A3Q8WWT9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC13A3Q8WWT9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC13A3Q8WWT9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC13A3Q8WWT9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC13A3Q8WWT9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC13A3Q8WWT9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC13A3Q8WWT9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC13A3Q8WWT9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC13A3Q8WWT9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC13A3Q8WWT9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC13A3Q8WWT9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC13A3Q8WWT9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC13A3Q8WWT9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC13A3Q8WWT9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC13A3Q8WWT9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC13A3Q8WWT9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC13A3Q8WWT9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC13A3Q8WWT9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC13A3Q8WWT9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC13A3Q8WWT9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC13A3Q8WWT9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC13A3Q8WWT9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC13A3Q8WWT9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC13A3Q8WWT9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC13A3Q8WWT9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC13A3Q8WWT9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC13A3Q8WWT9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC13A3Q8WWT9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC13A3Q8WWT9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC13A3Q8WWT9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC13A3Q8WWT9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC13A3Q8WWT9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC13A3Q8WWT9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC13A3Q8WWT9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC13A3Q8WWT9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC13A3Q8WWT9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC13A3Q8WWT9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC13A3Q8WWT9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC13A3Q8WWT9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC13A3Q8WWT9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC13A3Q8WWT9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC13A3Q8WWT9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC13A3Q8WWT9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC13A3Q8WWT9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC13A3Q8WWT9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC13A3Q8WWT9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC13A3Q8WWT9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC13A3Q8WWT9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC13A3Q8WWT9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC13A3Q8WWT9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC13A3Q8WWT9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC13A3Q8WWT9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC13A3Q8WWT9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC13A3Q8WWT9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC13A3Q8WWT9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC13A3Q8WWT9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC13A3Q8WWT9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC13A3Q8WWT9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC13A3Q8WWT9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC13A3Q8WWT9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC13A3Q8WWT9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC13A3Q8WWT9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC13A3Q8WWT9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC13A3Q8WWT9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC13A3Q8WWT9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC13A3Q8WWT9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC13A3Q8WWT9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC13A3Q8WWT9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC13A3Q8WWT9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC13A3Q8WWT9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC13A3Q8WWT9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC13A3Q8WWT9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC13A3Q8WWT9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms