Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVK2

SNRNP27, U4/U6.U5 small nuclear ribonucleoprotein 27 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP27Q8WVK2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNRNP27Q8WVK2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNRNP27Q8WVK2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNRNP27Q8WVK2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNRNP27Q8WVK2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNRNP27Q8WVK2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNRNP27Q8WVK2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNRNP27Q8WVK2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNRNP27Q8WVK2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNRNP27Q8WVK2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNRNP27Q8WVK2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNRNP27Q8WVK2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SNRNP27Q8WVK2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNRNP27Q8WVK2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNRNP27Q8WVK2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNRNP27Q8WVK2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNRNP27Q8WVK2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNRNP27Q8WVK2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNRNP27Q8WVK2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNRNP27Q8WVK2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNRNP27Q8WVK2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNRNP27Q8WVK2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNRNP27Q8WVK2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNRNP27Q8WVK2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNRNP27Q8WVK2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNRNP27Q8WVK2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNRNP27Q8WVK2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNRNP27Q8WVK2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNRNP27Q8WVK2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNRNP27Q8WVK2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNRNP27Q8WVK2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNRNP27Q8WVK2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNRNP27Q8WVK2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNRNP27Q8WVK2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNRNP27Q8WVK2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNRNP27Q8WVK2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNRNP27Q8WVK2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNRNP27Q8WVK2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNRNP27Q8WVK2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNRNP27Q8WVK2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNRNP27Q8WVK2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNRNP27Q8WVK2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNRNP27Q8WVK2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNRNP27Q8WVK2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNRNP27Q8WVK2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNRNP27Q8WVK2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNRNP27Q8WVK2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNRNP27Q8WVK2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNRNP27Q8WVK2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNRNP27Q8WVK2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNRNP27Q8WVK2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNRNP27Q8WVK2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNRNP27Q8WVK2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNRNP27Q8WVK2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNRNP27Q8WVK2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SNRNP27Q8WVK2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNRNP27Q8WVK2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNRNP27Q8WVK2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SNRNP27Q8WVK2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNRNP27Q8WVK2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNRNP27Q8WVK2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNRNP27Q8WVK2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNRNP27Q8WVK2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNRNP27Q8WVK2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNRNP27Q8WVK2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNRNP27Q8WVK2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNRNP27Q8WVK2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNRNP27Q8WVK2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SNRNP27Q8WVK2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNRNP27Q8WVK2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNRNP27Q8WVK2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNRNP27Q8WVK2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNRNP27Q8WVK2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNRNP27Q8WVK2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNRNP27Q8WVK2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNRNP27Q8WVK2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNRNP27Q8WVK2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNRNP27Q8WVK2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNRNP27Q8WVK2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNRNP27Q8WVK2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNRNP27Q8WVK2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNRNP27Q8WVK2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNRNP27Q8WVK2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNRNP27Q8WVK2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNRNP27Q8WVK2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNRNP27Q8WVK2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNRNP27Q8WVK2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNRNP27Q8WVK2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNRNP27Q8WVK2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNRNP27Q8WVK2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNRNP27Q8WVK2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNRNP27Q8WVK2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNRNP27Q8WVK2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNRNP27Q8WVK2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNRNP27Q8WVK2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNRNP27Q8WVK2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNRNP27Q8WVK2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNRNP27Q8WVK2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNRNP27Q8WVK2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNRNP27Q8WVK2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms