Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD1

RAB2B, Ras-related protein Rab-2B, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB2BQ8WUD1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB2BQ8WUD1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB2BQ8WUD1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB2BQ8WUD1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB2BQ8WUD1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB2BQ8WUD1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB2BQ8WUD1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB2BQ8WUD1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB2BQ8WUD1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB2BQ8WUD1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB2BQ8WUD1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB2BQ8WUD1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB2BQ8WUD1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB2BQ8WUD1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB2BQ8WUD1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB2BQ8WUD1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB2BQ8WUD1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB2BQ8WUD1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB2BQ8WUD1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB2BQ8WUD1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB2BQ8WUD1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB2BQ8WUD1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB2BQ8WUD1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB2BQ8WUD1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB2BQ8WUD1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB2BQ8WUD1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB2BQ8WUD1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB2BQ8WUD1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB2BQ8WUD1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB2BQ8WUD1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB2BQ8WUD1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB2BQ8WUD1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB2BQ8WUD1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB2BQ8WUD1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB2BQ8WUD1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB2BQ8WUD1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB2BQ8WUD1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB2BQ8WUD1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB2BQ8WUD1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB2BQ8WUD1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB2BQ8WUD1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB2BQ8WUD1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB2BQ8WUD1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB2BQ8WUD1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB2BQ8WUD1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB2BQ8WUD1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAB2BQ8WUD1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB2BQ8WUD1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB2BQ8WUD1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB2BQ8WUD1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB2BQ8WUD1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB2BQ8WUD1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB2BQ8WUD1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB2BQ8WUD1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB2BQ8WUD1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB2BQ8WUD1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB2BQ8WUD1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB2BQ8WUD1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB2BQ8WUD1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB2BQ8WUD1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB2BQ8WUD1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB2BQ8WUD1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB2BQ8WUD1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB2BQ8WUD1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB2BQ8WUD1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB2BQ8WUD1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB2BQ8WUD1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB2BQ8WUD1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB2BQ8WUD1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB2BQ8WUD1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB2BQ8WUD1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RAB2BQ8WUD1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RAB2BQ8WUD1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB2BQ8WUD1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB2BQ8WUD1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB2BQ8WUD1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB2BQ8WUD1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB2BQ8WUD1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB2BQ8WUD1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB2BQ8WUD1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB2BQ8WUD1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB2BQ8WUD1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB2BQ8WUD1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB2BQ8WUD1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB2BQ8WUD1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB2BQ8WUD1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB2BQ8WUD1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB2BQ8WUD1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB2BQ8WUD1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB2BQ8WUD1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB2BQ8WUD1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB2BQ8WUD1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB2BQ8WUD1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB2BQ8WUD1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB2BQ8WUD1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB2BQ8WUD1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB2BQ8WUD1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB2BQ8WUD1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB2BQ8WUD1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB2BQ8WUD1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms