Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC148Q8NFR7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC148Q8NFR7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC148Q8NFR7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC148Q8NFR7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC148Q8NFR7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC148Q8NFR7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC148Q8NFR7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC148Q8NFR7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC148Q8NFR7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC148Q8NFR7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC148Q8NFR7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC148Q8NFR7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC148Q8NFR7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC148Q8NFR7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC148Q8NFR7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC148Q8NFR7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC148Q8NFR7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC148Q8NFR7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC148Q8NFR7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC148Q8NFR7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC148Q8NFR7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC148Q8NFR7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC148Q8NFR7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC148Q8NFR7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC148Q8NFR7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC148Q8NFR7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC148Q8NFR7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC148Q8NFR7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC148Q8NFR7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC148Q8NFR7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC148Q8NFR7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC148Q8NFR7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC148Q8NFR7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC148Q8NFR7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC148Q8NFR7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC148Q8NFR7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC148Q8NFR7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC148Q8NFR7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC148Q8NFR7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC148Q8NFR7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC148Q8NFR7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC148Q8NFR7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC148Q8NFR7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC148Q8NFR7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC148Q8NFR7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC148Q8NFR7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC148Q8NFR7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC148Q8NFR7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC148Q8NFR7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC148Q8NFR7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC148Q8NFR7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC148Q8NFR7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC148Q8NFR7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC148Q8NFR7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC148Q8NFR7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC148Q8NFR7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC148Q8NFR7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC148Q8NFR7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC148Q8NFR7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC148Q8NFR7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC148Q8NFR7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC148Q8NFR7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC148Q8NFR7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC148Q8NFR7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC148Q8NFR7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC148Q8NFR7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC148Q8NFR7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC148Q8NFR7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC148Q8NFR7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC148Q8NFR7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC148Q8NFR7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC148Q8NFR7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC148Q8NFR7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC148Q8NFR7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC148Q8NFR7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC148Q8NFR7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC148Q8NFR7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC148Q8NFR7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC148Q8NFR7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC148Q8NFR7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC148Q8NFR7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC148Q8NFR7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC148Q8NFR7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC148Q8NFR7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC148Q8NFR7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC148Q8NFR7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC148Q8NFR7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC148Q8NFR7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC148Q8NFR7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC148Q8NFR7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC148Q8NFR7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC148Q8NFR7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC148Q8NFR7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC148Q8NFR7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC148Q8NFR7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC148Q8NFR7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC148Q8NFR7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC148Q8NFR7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC148Q8NFR7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms