Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB14

USP38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP38Q8NB14 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
USP38Q8NB14 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
USP38Q8NB14 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
USP38Q8NB14 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
USP38Q8NB14 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
USP38Q8NB14 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP38Q8NB14 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP38Q8NB14 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
USP38Q8NB14 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP38Q8NB14 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP38Q8NB14 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP38Q8NB14 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP38Q8NB14 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP38Q8NB14 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP38Q8NB14 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP38Q8NB14 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP38Q8NB14 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP38Q8NB14 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP38Q8NB14 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP38Q8NB14 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP38Q8NB14 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP38Q8NB14 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP38Q8NB14 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP38Q8NB14 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP38Q8NB14 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP38Q8NB14 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
USP38Q8NB14 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP38Q8NB14 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP38Q8NB14 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
USP38Q8NB14 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
USP38Q8NB14 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP38Q8NB14 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP38Q8NB14 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP38Q8NB14 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP38Q8NB14 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP38Q8NB14 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP38Q8NB14 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP38Q8NB14 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP38Q8NB14 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP38Q8NB14 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP38Q8NB14 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP38Q8NB14 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP38Q8NB14 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP38Q8NB14 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP38Q8NB14 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
USP38Q8NB14 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
USP38Q8NB14 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP38Q8NB14 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP38Q8NB14 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP38Q8NB14 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP38Q8NB14 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP38Q8NB14 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP38Q8NB14 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP38Q8NB14 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP38Q8NB14 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP38Q8NB14 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP38Q8NB14 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP38Q8NB14 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP38Q8NB14 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP38Q8NB14 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP38Q8NB14 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP38Q8NB14 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP38Q8NB14 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP38Q8NB14 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP38Q8NB14 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
USP38Q8NB14 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP38Q8NB14 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP38Q8NB14 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP38Q8NB14 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP38Q8NB14 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP38Q8NB14 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP38Q8NB14 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP38Q8NB14 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP38Q8NB14 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP38Q8NB14 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP38Q8NB14 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP38Q8NB14 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP38Q8NB14 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP38Q8NB14 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP38Q8NB14 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP38Q8NB14 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP38Q8NB14 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP38Q8NB14 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP38Q8NB14 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
USP38Q8NB14 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP38Q8NB14 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP38Q8NB14 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP38Q8NB14 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP38Q8NB14 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
USP38Q8NB14 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
USP38Q8NB14 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
USP38Q8NB14 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP38Q8NB14 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP38Q8NB14 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
USP38Q8NB14 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP38Q8NB14 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
USP38Q8NB14 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
USP38Q8NB14 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP38Q8NB14 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP38Q8NB14 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms