Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SFRP1Q8N474 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SFRP1Q8N474 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SFRP1Q8N474 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SFRP1Q8N474 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SFRP1Q8N474 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SFRP1Q8N474 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SFRP1Q8N474 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SFRP1Q8N474 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SFRP1Q8N474 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SFRP1Q8N474 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SFRP1Q8N474 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SFRP1Q8N474 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SFRP1Q8N474 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SFRP1Q8N474 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SFRP1Q8N474 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SFRP1Q8N474 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SFRP1Q8N474 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SFRP1Q8N474 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SFRP1Q8N474 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SFRP1Q8N474 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SFRP1Q8N474 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SFRP1Q8N474 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SFRP1Q8N474 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SFRP1Q8N474 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SFRP1Q8N474 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SFRP1Q8N474 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SFRP1Q8N474 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SFRP1Q8N474 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SFRP1Q8N474 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SFRP1Q8N474 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SFRP1Q8N474 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SFRP1Q8N474 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SFRP1Q8N474 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SFRP1Q8N474 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SFRP1Q8N474 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SFRP1Q8N474 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SFRP1Q8N474 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SFRP1Q8N474 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SFRP1Q8N474 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SFRP1Q8N474 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SFRP1Q8N474 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SFRP1Q8N474 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SFRP1Q8N474 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SFRP1Q8N474 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SFRP1Q8N474 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SFRP1Q8N474 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SFRP1Q8N474 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SFRP1Q8N474 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SFRP1Q8N474 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SFRP1Q8N474 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SFRP1Q8N474 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SFRP1Q8N474 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SFRP1Q8N474 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SFRP1Q8N474 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SFRP1Q8N474 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SFRP1Q8N474 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SFRP1Q8N474 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SFRP1Q8N474 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SFRP1Q8N474 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SFRP1Q8N474 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SFRP1Q8N474 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SFRP1Q8N474 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SFRP1Q8N474 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SFRP1Q8N474 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SFRP1Q8N474 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SFRP1Q8N474 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SFRP1Q8N474 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SFRP1Q8N474 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SFRP1Q8N474 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SFRP1Q8N474 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SFRP1Q8N474 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SFRP1Q8N474 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SFRP1Q8N474 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SFRP1Q8N474 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SFRP1Q8N474 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SFRP1Q8N474 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SFRP1Q8N474 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SFRP1Q8N474 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SFRP1Q8N474 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SFRP1Q8N474 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SFRP1Q8N474 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SFRP1Q8N474 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SFRP1Q8N474 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SFRP1Q8N474 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SFRP1Q8N474 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SFRP1Q8N474 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SFRP1Q8N474 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SFRP1Q8N474 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SFRP1Q8N474 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SFRP1Q8N474 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SFRP1Q8N474 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SFRP1Q8N474 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SFRP1Q8N474 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SFRP1Q8N474 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SFRP1Q8N474 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SFRP1Q8N474 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SFRP1Q8N474 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SFRP1Q8N474 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SFRP1Q8N474 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms