Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2U9

PQLC1, PQ-loop repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PQLC1Q8N2U9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PQLC1Q8N2U9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PQLC1Q8N2U9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PQLC1Q8N2U9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PQLC1Q8N2U9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PQLC1Q8N2U9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PQLC1Q8N2U9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PQLC1Q8N2U9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PQLC1Q8N2U9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PQLC1Q8N2U9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PQLC1Q8N2U9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PQLC1Q8N2U9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PQLC1Q8N2U9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PQLC1Q8N2U9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PQLC1Q8N2U9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PQLC1Q8N2U9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PQLC1Q8N2U9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PQLC1Q8N2U9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PQLC1Q8N2U9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PQLC1Q8N2U9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PQLC1Q8N2U9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PQLC1Q8N2U9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PQLC1Q8N2U9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PQLC1Q8N2U9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PQLC1Q8N2U9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PQLC1Q8N2U9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PQLC1Q8N2U9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PQLC1Q8N2U9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PQLC1Q8N2U9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PQLC1Q8N2U9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PQLC1Q8N2U9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PQLC1Q8N2U9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PQLC1Q8N2U9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PQLC1Q8N2U9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PQLC1Q8N2U9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PQLC1Q8N2U9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PQLC1Q8N2U9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PQLC1Q8N2U9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PQLC1Q8N2U9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PQLC1Q8N2U9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PQLC1Q8N2U9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PQLC1Q8N2U9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PQLC1Q8N2U9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PQLC1Q8N2U9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PQLC1Q8N2U9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PQLC1Q8N2U9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PQLC1Q8N2U9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PQLC1Q8N2U9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PQLC1Q8N2U9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PQLC1Q8N2U9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PQLC1Q8N2U9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PQLC1Q8N2U9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PQLC1Q8N2U9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PQLC1Q8N2U9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PQLC1Q8N2U9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PQLC1Q8N2U9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PQLC1Q8N2U9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PQLC1Q8N2U9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PQLC1Q8N2U9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PQLC1Q8N2U9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PQLC1Q8N2U9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PQLC1Q8N2U9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PQLC1Q8N2U9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PQLC1Q8N2U9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PQLC1Q8N2U9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PQLC1Q8N2U9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PQLC1Q8N2U9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PQLC1Q8N2U9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PQLC1Q8N2U9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PQLC1Q8N2U9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PQLC1Q8N2U9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PQLC1Q8N2U9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PQLC1Q8N2U9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PQLC1Q8N2U9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PQLC1Q8N2U9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PQLC1Q8N2U9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PQLC1Q8N2U9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PQLC1Q8N2U9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PQLC1Q8N2U9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PQLC1Q8N2U9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PQLC1Q8N2U9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PQLC1Q8N2U9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PQLC1Q8N2U9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PQLC1Q8N2U9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PQLC1Q8N2U9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PQLC1Q8N2U9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PQLC1Q8N2U9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PQLC1Q8N2U9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PQLC1Q8N2U9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PQLC1Q8N2U9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PQLC1Q8N2U9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PQLC1Q8N2U9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PQLC1Q8N2U9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PQLC1Q8N2U9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PQLC1Q8N2U9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PQLC1Q8N2U9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PQLC1Q8N2U9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PQLC1Q8N2U9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PQLC1Q8N2U9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PQLC1Q8N2U9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms