Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQE4

Nemp1, Nuclear envelope integral membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nemp1Q6ZQE4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nemp1Q6ZQE4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nemp1Q6ZQE4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nemp1Q6ZQE4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nemp1Q6ZQE4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nemp1Q6ZQE4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nemp1Q6ZQE4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nemp1Q6ZQE4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nemp1Q6ZQE4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nemp1Q6ZQE4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nemp1Q6ZQE4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nemp1Q6ZQE4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nemp1Q6ZQE4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nemp1Q6ZQE4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nemp1Q6ZQE4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nemp1Q6ZQE4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nemp1Q6ZQE4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nemp1Q6ZQE4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nemp1Q6ZQE4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nemp1Q6ZQE4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nemp1Q6ZQE4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nemp1Q6ZQE4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nemp1Q6ZQE4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nemp1Q6ZQE4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nemp1Q6ZQE4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nemp1Q6ZQE4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nemp1Q6ZQE4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nemp1Q6ZQE4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nemp1Q6ZQE4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nemp1Q6ZQE4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nemp1Q6ZQE4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nemp1Q6ZQE4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nemp1Q6ZQE4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nemp1Q6ZQE4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nemp1Q6ZQE4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nemp1Q6ZQE4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nemp1Q6ZQE4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nemp1Q6ZQE4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nemp1Q6ZQE4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nemp1Q6ZQE4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nemp1Q6ZQE4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nemp1Q6ZQE4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nemp1Q6ZQE4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nemp1Q6ZQE4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nemp1Q6ZQE4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nemp1Q6ZQE4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nemp1Q6ZQE4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nemp1Q6ZQE4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Nemp1Q6ZQE4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nemp1Q6ZQE4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nemp1Q6ZQE4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nemp1Q6ZQE4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nemp1Q6ZQE4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nemp1Q6ZQE4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nemp1Q6ZQE4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nemp1Q6ZQE4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nemp1Q6ZQE4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nemp1Q6ZQE4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nemp1Q6ZQE4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nemp1Q6ZQE4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nemp1Q6ZQE4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nemp1Q6ZQE4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nemp1Q6ZQE4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nemp1Q6ZQE4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nemp1Q6ZQE4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nemp1Q6ZQE4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Nemp1Q6ZQE4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nemp1Q6ZQE4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nemp1Q6ZQE4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nemp1Q6ZQE4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nemp1Q6ZQE4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nemp1Q6ZQE4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nemp1Q6ZQE4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nemp1Q6ZQE4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nemp1Q6ZQE4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nemp1Q6ZQE4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nemp1Q6ZQE4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nemp1Q6ZQE4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nemp1Q6ZQE4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nemp1Q6ZQE4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nemp1Q6ZQE4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nemp1Q6ZQE4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nemp1Q6ZQE4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nemp1Q6ZQE4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nemp1Q6ZQE4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nemp1Q6ZQE4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Nemp1Q6ZQE4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nemp1Q6ZQE4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nemp1Q6ZQE4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nemp1Q6ZQE4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nemp1Q6ZQE4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nemp1Q6ZQE4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nemp1Q6ZQE4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nemp1Q6ZQE4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nemp1Q6ZQE4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nemp1Q6ZQE4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nemp1Q6ZQE4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nemp1Q6ZQE4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nemp1Q6ZQE4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nemp1Q6ZQE4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 239.7 ms