Protein–RNA interactions for Protein: Q6YHK3

CD109, CD109 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD109Q6YHK3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
CD109Q6YHK3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
CD109Q6YHK3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
CD109Q6YHK3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.25■■■■■ 4.03
CD109Q6YHK3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC40.25■■■■■ 4.03
CD109Q6YHK3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.25■■■■■ 4.03
CD109Q6YHK3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC40.24■■■■■ 4.03
CD109Q6YHK3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
CD109Q6YHK3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC40.23■■■■■ 4.03
CD109Q6YHK3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
CD109Q6YHK3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
CD109Q6YHK3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.21■■■■■ 4.03
CD109Q6YHK3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
CD109Q6YHK3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
CD109Q6YHK3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC40.21■■■■■ 4.03
CD109Q6YHK3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC40.21■■■■■ 4.03
CD109Q6YHK3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC40.21■■■■■ 4.03
CD109Q6YHK3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
CD109Q6YHK3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
CD109Q6YHK3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC40.19■■■■■ 4.02
CD109Q6YHK3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
CD109Q6YHK3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.19■■■■■ 4.02
CD109Q6YHK3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
CD109Q6YHK3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
CD109Q6YHK3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
CD109Q6YHK3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC40.16■■■■■ 4.02
CD109Q6YHK3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
CD109Q6YHK3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
CD109Q6YHK3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
CD109Q6YHK3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
CD109Q6YHK3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
CD109Q6YHK3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
CD109Q6YHK3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
CD109Q6YHK3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.01
CD109Q6YHK3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC40.13■■■■■ 4.01
CD109Q6YHK3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC40.12■■■■■ 4.01
CD109Q6YHK3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC40.1■■■■■ 4.01
CD109Q6YHK3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
CD109Q6YHK3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
CD109Q6YHK3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC40.09■■■■■ 4.01
CD109Q6YHK3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
CD109Q6YHK3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC40.08■■■■■ 4.01
CD109Q6YHK3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
CD109Q6YHK3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC40.08■■■■■ 4.01
CD109Q6YHK3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.08■■■■■ 4.01
CD109Q6YHK3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
CD109Q6YHK3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC40.07■■■■■ 4
CD109Q6YHK3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC40.07■■■■■ 4
CD109Q6YHK3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
CD109Q6YHK3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.05■■■■■ 4
CD109Q6YHK3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
CD109Q6YHK3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
CD109Q6YHK3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
CD109Q6YHK3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC40.03■■■■■ 4
CD109Q6YHK3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC40.02■■■■■ 4
CD109Q6YHK3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
CD109Q6YHK3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC40.02■■■■■ 4
CD109Q6YHK3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC40.01■■■■□ 3.99
CD109Q6YHK3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
CD109Q6YHK3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40■■■■□ 3.99
CD109Q6YHK3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
CD109Q6YHK3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC40■■■■□ 3.99
CD109Q6YHK3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40■■■■□ 3.99
CD109Q6YHK3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC39.99■■■■□ 3.99
CD109Q6YHK3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC39.99■■■■□ 3.99
CD109Q6YHK3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
CD109Q6YHK3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
CD109Q6YHK3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC39.99■■■■□ 3.99
CD109Q6YHK3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
CD109Q6YHK3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC39.98■■■■□ 3.99
CD109Q6YHK3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC39.98■■■■□ 3.99
CD109Q6YHK3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC39.98■■■■□ 3.99
CD109Q6YHK3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC39.98■■■■□ 3.99
CD109Q6YHK3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC39.98■■■■□ 3.99
CD109Q6YHK3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC39.96■■■■□ 3.99
CD109Q6YHK3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
CD109Q6YHK3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
CD109Q6YHK3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
CD109Q6YHK3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
CD109Q6YHK3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
CD109Q6YHK3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
CD109Q6YHK3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC39.94■■■■□ 3.98
CD109Q6YHK3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
CD109Q6YHK3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC39.94■■■■□ 3.98
CD109Q6YHK3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
CD109Q6YHK3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC39.93■■■■□ 3.98
CD109Q6YHK3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
CD109Q6YHK3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC39.92■■■■□ 3.98
CD109Q6YHK3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC39.92■■■■□ 3.98
CD109Q6YHK3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC39.91■■■■□ 3.98
CD109Q6YHK3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC39.91■■■■□ 3.98
CD109Q6YHK3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC39.9■■■■□ 3.98
CD109Q6YHK3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.9■■■■□ 3.98
CD109Q6YHK3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC39.9■■■■□ 3.98
CD109Q6YHK3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC39.9■■■■□ 3.98
CD109Q6YHK3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
CD109Q6YHK3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
CD109Q6YHK3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
CD109Q6YHK3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC39.87■■■■□ 3.97
CD109Q6YHK3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms