Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW40

RGMB, RGM domain family member B, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMBQ6NW40 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
RGMBQ6NW40 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
RGMBQ6NW40 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
RGMBQ6NW40 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
RGMBQ6NW40 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
RGMBQ6NW40 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
RGMBQ6NW40 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
RGMBQ6NW40 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
RGMBQ6NW40 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
RGMBQ6NW40 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
RGMBQ6NW40 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
RGMBQ6NW40 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
RGMBQ6NW40 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
RGMBQ6NW40 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
RGMBQ6NW40 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
RGMBQ6NW40 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
RGMBQ6NW40 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
RGMBQ6NW40 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
RGMBQ6NW40 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
RGMBQ6NW40 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
RGMBQ6NW40 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
RGMBQ6NW40 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
RGMBQ6NW40 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
RGMBQ6NW40 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
RGMBQ6NW40 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
RGMBQ6NW40 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
RGMBQ6NW40 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
RGMBQ6NW40 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
RGMBQ6NW40 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
RGMBQ6NW40 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
RGMBQ6NW40 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
RGMBQ6NW40 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
RGMBQ6NW40 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
RGMBQ6NW40 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
RGMBQ6NW40 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
RGMBQ6NW40 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RGMBQ6NW40 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RGMBQ6NW40 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RGMBQ6NW40 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
RGMBQ6NW40 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
RGMBQ6NW40 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RGMBQ6NW40 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
RGMBQ6NW40 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
RGMBQ6NW40 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
RGMBQ6NW40 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
RGMBQ6NW40 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC30.39■■■□□ 2.45
RGMBQ6NW40 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RGMBQ6NW40 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
RGMBQ6NW40 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RGMBQ6NW40 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RGMBQ6NW40 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
RGMBQ6NW40 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
RGMBQ6NW40 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RGMBQ6NW40 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RGMBQ6NW40 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
RGMBQ6NW40 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
RGMBQ6NW40 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
RGMBQ6NW40 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC30.36■■■□□ 2.45
RGMBQ6NW40 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
RGMBQ6NW40 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
RGMBQ6NW40 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
RGMBQ6NW40 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
RGMBQ6NW40 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
RGMBQ6NW40 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
RGMBQ6NW40 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
RGMBQ6NW40 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
RGMBQ6NW40 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
RGMBQ6NW40 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RGMBQ6NW40 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
RGMBQ6NW40 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RGMBQ6NW40 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
RGMBQ6NW40 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RGMBQ6NW40 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
RGMBQ6NW40 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
RGMBQ6NW40 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
RGMBQ6NW40 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RGMBQ6NW40 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RGMBQ6NW40 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RGMBQ6NW40 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
RGMBQ6NW40 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RGMBQ6NW40 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
RGMBQ6NW40 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RGMBQ6NW40 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RGMBQ6NW40 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RGMBQ6NW40 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RGMBQ6NW40 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
RGMBQ6NW40 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RGMBQ6NW40 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
RGMBQ6NW40 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
RGMBQ6NW40 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
RGMBQ6NW40 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RGMBQ6NW40 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RGMBQ6NW40 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RGMBQ6NW40 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
RGMBQ6NW40 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RGMBQ6NW40 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RGMBQ6NW40 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RGMBQ6NW40 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RGMBQ6NW40 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
RGMBQ6NW40 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms