Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX52

SPATA1, Spermatogenesis-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA1Q5VX52 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SPATA1Q5VX52 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SPATA1Q5VX52 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SPATA1Q5VX52 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SPATA1Q5VX52 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SPATA1Q5VX52 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SPATA1Q5VX52 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SPATA1Q5VX52 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SPATA1Q5VX52 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SPATA1Q5VX52 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SPATA1Q5VX52 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SPATA1Q5VX52 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SPATA1Q5VX52 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SPATA1Q5VX52 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SPATA1Q5VX52 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SPATA1Q5VX52 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SPATA1Q5VX52 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SPATA1Q5VX52 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SPATA1Q5VX52 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SPATA1Q5VX52 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SPATA1Q5VX52 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SPATA1Q5VX52 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SPATA1Q5VX52 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SPATA1Q5VX52 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SPATA1Q5VX52 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SPATA1Q5VX52 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SPATA1Q5VX52 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SPATA1Q5VX52 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SPATA1Q5VX52 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SPATA1Q5VX52 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SPATA1Q5VX52 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SPATA1Q5VX52 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SPATA1Q5VX52 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SPATA1Q5VX52 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SPATA1Q5VX52 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SPATA1Q5VX52 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SPATA1Q5VX52 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SPATA1Q5VX52 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SPATA1Q5VX52 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SPATA1Q5VX52 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SPATA1Q5VX52 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SPATA1Q5VX52 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
SPATA1Q5VX52 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.16
SPATA1Q5VX52 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SPATA1Q5VX52 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SPATA1Q5VX52 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SPATA1Q5VX52 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SPATA1Q5VX52 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SPATA1Q5VX52 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SPATA1Q5VX52 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SPATA1Q5VX52 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SPATA1Q5VX52 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SPATA1Q5VX52 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SPATA1Q5VX52 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SPATA1Q5VX52 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SPATA1Q5VX52 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SPATA1Q5VX52 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SPATA1Q5VX52 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SPATA1Q5VX52 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SPATA1Q5VX52 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SPATA1Q5VX52 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SPATA1Q5VX52 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SPATA1Q5VX52 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SPATA1Q5VX52 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SPATA1Q5VX52 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
SPATA1Q5VX52 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SPATA1Q5VX52 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SPATA1Q5VX52 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SPATA1Q5VX52 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SPATA1Q5VX52 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SPATA1Q5VX52 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SPATA1Q5VX52 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SPATA1Q5VX52 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SPATA1Q5VX52 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SPATA1Q5VX52 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SPATA1Q5VX52 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SPATA1Q5VX52 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SPATA1Q5VX52 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SPATA1Q5VX52 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SPATA1Q5VX52 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SPATA1Q5VX52 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SPATA1Q5VX52 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SPATA1Q5VX52 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SPATA1Q5VX52 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SPATA1Q5VX52 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPATA1Q5VX52 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SPATA1Q5VX52 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPATA1Q5VX52 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SPATA1Q5VX52 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SPATA1Q5VX52 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SPATA1Q5VX52 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SPATA1Q5VX52 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SPATA1Q5VX52 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SPATA1Q5VX52 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SPATA1Q5VX52 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SPATA1Q5VX52 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SPATA1Q5VX52 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SPATA1Q5VX52 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SPATA1Q5VX52 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SPATA1Q5VX52 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms