Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9S5

CCDC18, Coiled-coil domain-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18Q5T9S5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
CCDC18Q5T9S5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC40.45■■■■■ 4.07
CCDC18Q5T9S5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
CCDC18Q5T9S5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.43■■■■■ 4.06
CCDC18Q5T9S5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC40.43■■■■■ 4.06
CCDC18Q5T9S5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC40.42■■■■■ 4.06
CCDC18Q5T9S5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC40.42■■■■■ 4.06
CCDC18Q5T9S5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
CCDC18Q5T9S5 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
CCDC18Q5T9S5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
CCDC18Q5T9S5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
CCDC18Q5T9S5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
CCDC18Q5T9S5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
CCDC18Q5T9S5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
CCDC18Q5T9S5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
CCDC18Q5T9S5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
CCDC18Q5T9S5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC40.37■■■■■ 4.05
CCDC18Q5T9S5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
CCDC18Q5T9S5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.37■■■■■ 4.05
CCDC18Q5T9S5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.36■■■■■ 4.05
CCDC18Q5T9S5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC40.36■■■■■ 4.05
CCDC18Q5T9S5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC40.36■■■■■ 4.05
CCDC18Q5T9S5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC40.35■■■■■ 4.05
CCDC18Q5T9S5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
CCDC18Q5T9S5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
CCDC18Q5T9S5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
CCDC18Q5T9S5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
CCDC18Q5T9S5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC40.34■■■■■ 4.05
CCDC18Q5T9S5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
CCDC18Q5T9S5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC40.33■■■■■ 4.05
CCDC18Q5T9S5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC40.32■■■■■ 4.05
CCDC18Q5T9S5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
CCDC18Q5T9S5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
CCDC18Q5T9S5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.31■■■■■ 4.04
CCDC18Q5T9S5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC40.3■■■■■ 4.04
CCDC18Q5T9S5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
CCDC18Q5T9S5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.3■■■■■ 4.04
CCDC18Q5T9S5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC40.3■■■■■ 4.04
CCDC18Q5T9S5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
CCDC18Q5T9S5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
CCDC18Q5T9S5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC40.27■■■■■ 4.04
CCDC18Q5T9S5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC40.27■■■■■ 4.04
CCDC18Q5T9S5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC40.27■■■■■ 4.04
CCDC18Q5T9S5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC40.27■■■■■ 4.04
CCDC18Q5T9S5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.03
CCDC18Q5T9S5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC40.26■■■■■ 4.03
CCDC18Q5T9S5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC40.26■■■■■ 4.03
CCDC18Q5T9S5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
CCDC18Q5T9S5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC40.25■■■■■ 4.03
CCDC18Q5T9S5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
CCDC18Q5T9S5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.24■■■■■ 4.03
CCDC18Q5T9S5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC40.24■■■■■ 4.03
CCDC18Q5T9S5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
CCDC18Q5T9S5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC40.23■■■■■ 4.03
CCDC18Q5T9S5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
CCDC18Q5T9S5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
CCDC18Q5T9S5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
CCDC18Q5T9S5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
CCDC18Q5T9S5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC40.21■■■■■ 4.03
CCDC18Q5T9S5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
CCDC18Q5T9S5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
CCDC18Q5T9S5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC40.19■■■■■ 4.03
CCDC18Q5T9S5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.19■■■■■ 4.02
CCDC18Q5T9S5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
CCDC18Q5T9S5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
CCDC18Q5T9S5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
CCDC18Q5T9S5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
CCDC18Q5T9S5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC40.18■■■■■ 4.02
CCDC18Q5T9S5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC40.17■■■■■ 4.02
CCDC18Q5T9S5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
CCDC18Q5T9S5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
CCDC18Q5T9S5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC40.17■■■■■ 4.02
CCDC18Q5T9S5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
CCDC18Q5T9S5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
CCDC18Q5T9S5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
CCDC18Q5T9S5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.15■■■■■ 4.02
CCDC18Q5T9S5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.15■■■■■ 4.02
CCDC18Q5T9S5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
CCDC18Q5T9S5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.15■■■■■ 4.02
CCDC18Q5T9S5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
CCDC18Q5T9S5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC40.14■■■■■ 4.02
CCDC18Q5T9S5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC40.14■■■■■ 4.02
CCDC18Q5T9S5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.14■■■■■ 4.02
CCDC18Q5T9S5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
CCDC18Q5T9S5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC40.12■■■■■ 4.01
CCDC18Q5T9S5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
CCDC18Q5T9S5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC40.11■■■■■ 4.01
CCDC18Q5T9S5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
CCDC18Q5T9S5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.1■■■■■ 4.01
CCDC18Q5T9S5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
CCDC18Q5T9S5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
CCDC18Q5T9S5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC40.09■■■■■ 4.01
CCDC18Q5T9S5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
CCDC18Q5T9S5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC40.09■■■■■ 4.01
CCDC18Q5T9S5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.08■■■■■ 4.01
CCDC18Q5T9S5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
CCDC18Q5T9S5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC40.07■■■■■ 4.01
CCDC18Q5T9S5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
CCDC18Q5T9S5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC40.06■■■■■ 4
CCDC18Q5T9S5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC40.06■■■■■ 4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms