Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ68

SPDYC, Speedy protein C, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDYCQ5MJ68 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SPDYCQ5MJ68 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SPDYCQ5MJ68 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SPDYCQ5MJ68 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SPDYCQ5MJ68 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPDYCQ5MJ68 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPDYCQ5MJ68 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SPDYCQ5MJ68 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SPDYCQ5MJ68 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SPDYCQ5MJ68 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SPDYCQ5MJ68 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SPDYCQ5MJ68 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPDYCQ5MJ68 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPDYCQ5MJ68 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPDYCQ5MJ68 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPDYCQ5MJ68 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SPDYCQ5MJ68 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SPDYCQ5MJ68 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SPDYCQ5MJ68 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPDYCQ5MJ68 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPDYCQ5MJ68 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPDYCQ5MJ68 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPDYCQ5MJ68 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPDYCQ5MJ68 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPDYCQ5MJ68 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPDYCQ5MJ68 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPDYCQ5MJ68 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPDYCQ5MJ68 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPDYCQ5MJ68 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPDYCQ5MJ68 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SPDYCQ5MJ68 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPDYCQ5MJ68 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SPDYCQ5MJ68 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPDYCQ5MJ68 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SPDYCQ5MJ68 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SPDYCQ5MJ68 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SPDYCQ5MJ68 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SPDYCQ5MJ68 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPDYCQ5MJ68 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPDYCQ5MJ68 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SPDYCQ5MJ68 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPDYCQ5MJ68 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPDYCQ5MJ68 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPDYCQ5MJ68 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPDYCQ5MJ68 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPDYCQ5MJ68 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPDYCQ5MJ68 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPDYCQ5MJ68 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPDYCQ5MJ68 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPDYCQ5MJ68 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPDYCQ5MJ68 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPDYCQ5MJ68 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPDYCQ5MJ68 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SPDYCQ5MJ68 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPDYCQ5MJ68 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPDYCQ5MJ68 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPDYCQ5MJ68 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPDYCQ5MJ68 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPDYCQ5MJ68 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SPDYCQ5MJ68 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPDYCQ5MJ68 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPDYCQ5MJ68 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPDYCQ5MJ68 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPDYCQ5MJ68 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SPDYCQ5MJ68 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPDYCQ5MJ68 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPDYCQ5MJ68 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPDYCQ5MJ68 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPDYCQ5MJ68 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPDYCQ5MJ68 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPDYCQ5MJ68 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SPDYCQ5MJ68 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SPDYCQ5MJ68 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SPDYCQ5MJ68 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPDYCQ5MJ68 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPDYCQ5MJ68 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPDYCQ5MJ68 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPDYCQ5MJ68 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPDYCQ5MJ68 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPDYCQ5MJ68 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPDYCQ5MJ68 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPDYCQ5MJ68 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPDYCQ5MJ68 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPDYCQ5MJ68 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPDYCQ5MJ68 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SPDYCQ5MJ68 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SPDYCQ5MJ68 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SPDYCQ5MJ68 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SPDYCQ5MJ68 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SPDYCQ5MJ68 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SPDYCQ5MJ68 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPDYCQ5MJ68 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPDYCQ5MJ68 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPDYCQ5MJ68 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPDYCQ5MJ68 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPDYCQ5MJ68 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPDYCQ5MJ68 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPDYCQ5MJ68 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPDYCQ5MJ68 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPDYCQ5MJ68 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms