Protein–RNA interactions for Protein: Q16629

SRSF7, Serine/arginine-rich splicing factor 7, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF7Q16629 ACTN1-215ENST00000555616 919 ntTSL 37.88□□□□□ -1.153e-14■■■■□ 24.7
SRSF7Q16629 ACTN1-213ENST00000554508 585 ntTSL 46.84□□□□□ -1.313e-14■■■■□ 24.7
SRSF7Q16629 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.45e-6■■■■□ 24.7
SRSF7Q16629 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.485e-6■■■■□ 24.7
SRSF7Q16629 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC11.22□□□□□ -0.615e-6■■■■□ 24.7
SRSF7Q16629 PCMTD2-203ENST00000308824 3843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.965e-6■■■■□ 24.7
SRSF7Q16629 PCMTD2-209ENST00000609818 551 ntTSL 45.36□□□□□ -1.555e-6■■■■□ 24.7
SRSF7Q16629 SYNJ2-205ENST00000449320 680 ntTSL 46.74□□□□□ -1.332e-7■■■■□ 24.6
SRSF7Q16629 SYNJ2-203ENST00000367113 939 ntTSL 26.31□□□□□ -1.42e-7■■■■□ 24.6
SRSF7Q16629 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.152e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.022e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 ATP6V0D1-211ENST00000565835 905 ntTSL 314.18□□□□□ -0.142e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.152e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 MSH5-SAPCD1-208ENST00000498473 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)13.78□□□□□ -0.22e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.252e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 ATP6V0D1-207ENST00000563305 1656 ntTSL 513.4□□□□□ -0.262e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.282e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 MSH5-SAPCD1-206ENST00000491552 706 ntTSL 313.04□□□□□ -0.322e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.372e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 MSH5-208ENST00000429846 616 ntTSL 311.43□□□□□ -0.582e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 ATP6V0D1-218ENST00000602876 1554 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.62e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.632e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.632e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 AGPAT3-207ENST00000445582 582 ntTSL 310.35□□□□□ -0.752e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 AGPAT3-208ENST00000448287 454 ntTSL 310.28□□□□□ -0.762e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 ATP6V0D1-217ENST00000568620 3390 ntTSL 29.91□□□□□ -0.822e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 MSH5-216ENST00000484309 857 ntTSL 59.59□□□□□ -0.872e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 DYNC1LI2-208ENST00000564833 727 ntTSL 49.08□□□□□ -0.962e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 DYNC1LI2-209ENST00000565532 744 ntTSL 58.95□□□□□ -0.982e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 NAP1L1-215ENST00000549479 573 ntTSL 28.92□□□□□ -0.982e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 ATP6V0D1-202ENST00000426604 1257 ntTSL 28.81□□□□□ -12e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 MSH5-205ENST00000395853 2704 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.162e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 NAP1L1-207ENST00000547479 623 ntTSL 57.39□□□□□ -1.232e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 DYNC1LI2-211ENST00000567499 3994 ntTSL 25.95□□□□□ -1.462e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 LINC00534-202ENST00000523283 772 ntTSL 25.43□□□□□ -1.542e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 LINC00534-203ENST00000523406 812 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.542e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 LINC00534-204ENST00000524361 620 ntTSL 34.77□□□□□ -1.652e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.672e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 SNHG8-204ENST00000602573 570 ntTSL 24.51□□□□□ -1.692e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 SAP30BP-212ENST00000580322 1558 ntTSL 519.26■□□□□ 0.679e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 SAP30BP-213ENST00000580484 686 ntTSL 315.52■□□□□ 0.089e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 SAP30BP-226ENST00000584861 579 ntTSL 213.6□□□□□ -0.239e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 SAP30BP-201ENST00000293208 1272 ntTSL 513.23□□□□□ -0.299e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 SAP30BP-221ENST00000583536 1000 ntTSL 312.91□□□□□ -0.349e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 SAP30BP-219ENST00000583170 553 ntTSL 412.91□□□□□ -0.349e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 SAP30BP-204ENST00000577292 1097 ntTSL 212.91□□□□□ -0.349e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 SAP30BP-217ENST00000582022 2409 ntTSL 1 (best)12.84□□□□□ -0.359e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 SAP30BP-205ENST00000578288 870 ntTSL 1 (best)12.13□□□□□ -0.479e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 SAP30BP-211ENST00000579877 561 ntTSL 211.91□□□□□ -0.59e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.539e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 SAP30BP-222ENST00000583737 525 ntTSL 411.5□□□□□ -0.579e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 SAP30BP-225ENST00000584667 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.589e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 SAP30BP-203ENST00000542343 1011 ntTSL 28.48□□□□□ -1.059e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 SAP30BP-208ENST00000578909 678 ntTSL 57.97□□□□□ -1.139e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 SAP30BP-206ENST00000578354 574 ntTSL 46.49□□□□□ -1.379e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 SAP30BP-210ENST00000579864 868 ntTSL 35.85□□□□□ -1.479e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.419e-7■■■■□ 24.4
SRSF7Q16629 PPARGC1A-217ENST00000613098 3210 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.393e-9■■■■□ 24.4
SRSF7Q16629 PPARGC1A-209ENST00000509702 2704 ntTSL 55.22□□□□□ -1.573e-9■■■■□ 24.4
SRSF7Q16629 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.683e-9■■■■□ 24.4
SRSF7Q16629 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.465e-12■■■■□ 24.4
SRSF7Q16629 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.232e-7■■■■□ 24.3
SRSF7Q16629 ATP11A-206ENST00000419631 2446 ntTSL 311.09□□□□□ -0.632e-7■■■■□ 24.3
SRSF7Q16629 ATP11A-210ENST00000471555 5786 ntTSL 1 (best)9.32□□□□□ -0.922e-7■■■■□ 24.3
SRSF7Q16629 L3MBTL1-205ENST00000422861 4322 ntAPPRIS ALT2 TSL 27.76□□□□□ -1.172e-7■■■■□ 24.3
SRSF7Q16629 Z98752.3-201ENST00000621802 566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.272e-7■■■■□ 24.3
SRSF7Q16629 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.68e-7■■■■□ 24.3
SRSF7Q16629 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.48e-7■■■■□ 24.3
SRSF7Q16629 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.398e-7■■■■□ 24.3
SRSF7Q16629 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.338e-7■■■■□ 24.3
SRSF7Q16629 ZGPAT-208ENST00000472711 787 ntTSL 315.94■□□□□ 0.148e-7■■■■□ 24.3
SRSF7Q16629 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.138e-7■■■■□ 24.3
SRSF7Q16629 ZGPAT-207ENST00000468235 594 ntTSL 1 (best)14.05□□□□□ -0.168e-7■■■■□ 24.3
SRSF7Q16629 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.268e-7■■■■□ 24.3
SRSF7Q16629 ZGPAT-209ENST00000477340 2831 ntTSL 213.33□□□□□ -0.288e-7■■■■□ 24.3
SRSF7Q16629 ZGPAT-210ENST00000478385 935 ntTSL 213.23□□□□□ -0.298e-7■■■■□ 24.3
SRSF7Q16629 FOXN3-211ENST00000555855 851 ntTSL 515.02■□□□□ -02e-6■■■■□ 24.2
SRSF7Q16629 ACOX2-213ENST00000492530 578 ntTSL 312.32□□□□□ -0.442e-6■■■■□ 24.2
SRSF7Q16629 ACOX2-208ENST00000474098 708 ntTSL 311.88□□□□□ -0.512e-6■■■■□ 24.2
SRSF7Q16629 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.562e-6■■■■□ 24.2
SRSF7Q16629 ACOX2-201ENST00000302819 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.612e-6■■■■□ 24.2
SRSF7Q16629 TRO-202ENST00000319167 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.632e-6■■■■□ 24.2
SRSF7Q16629 TRO-203ENST00000375022 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.632e-6■■■■□ 24.2
SRSF7Q16629 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.692e-6■■■■□ 24.2
SRSF7Q16629 TRO-215ENST00000445561 2597 ntTSL 1 (best)10.74□□□□□ -0.692e-6■■■■□ 24.2
SRSF7Q16629 TRO-224ENST00000492706 3677 ntTSL 210.12□□□□□ -0.792e-6■■■■□ 24.2
SRSF7Q16629 TRO-221ENST00000475183 632 ntTSL 310.09□□□□□ -0.792e-6■■■■□ 24.2
SRSF7Q16629 TRO-201ENST00000173898 4647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.812e-6■■■■□ 24.2
SRSF7Q16629 RBM5-211ENST00000462025 573 ntTSL 49.4□□□□□ -0.92e-6■■■■□ 24.2
SRSF7Q16629 ACOX2-202ENST00000459701 2348 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.972e-6■■■■□ 24.2
SRSF7Q16629 TRO-204ENST00000375041 3488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.062e-6■■■■□ 24.2
SRSF7Q16629 ACOX2-209ENST00000475143 426 ntTSL 58.25□□□□□ -1.092e-6■■■■□ 24.2
SRSF7Q16629 TRO-208ENST00000420798 3613 ntTSL 2 BASIC8.15□□□□□ -1.112e-6■■■■□ 24.2
SRSF7Q16629 RBM5-226ENST00000496179 1406 ntTSL 58.03□□□□□ -1.122e-6■■■■□ 24.2
SRSF7Q16629 TRO-219ENST00000469211 842 ntTSL 28□□□□□ -1.132e-6■■■■□ 24.2
SRSF7Q16629 AL137230.2-201ENST00000555070 452 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.162e-6■■■■□ 24.2
SRSF7Q16629 RBM5-201ENST00000347869 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.222e-6■■■■□ 24.2
SRSF7Q16629 RBM5-212ENST00000464087 5616 ntTSL 26.82□□□□□ -1.322e-6■■■■□ 24.2
SRSF7Q16629 RBM5-215ENST00000471995 762 ntTSL 36.77□□□□□ -1.332e-6■■■■□ 24.2
SRSF7Q16629 RBM5-202ENST00000395174 938 ntTSL 35.83□□□□□ -1.482e-6■■■■□ 24.2
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