Protein–RNA interactions for Protein: Q16629

SRSF7, Serine/arginine-rich splicing factor 7, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF7Q16629 ACTN1-215ENST00000555616 919 ntTSL 37.88□□□□□ -1.153e-14■■■■□ 24.7
SRSF7Q16629 ACTN1-213ENST00000554508 585 ntTSL 46.84□□□□□ -1.313e-14■■■■□ 24.7
SRSF7Q16629 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.45e-6■■■■□ 24.7
SRSF7Q16629 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.485e-6■■■■□ 24.7
SRSF7Q16629 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC11.22□□□□□ -0.615e-6■■■■□ 24.7
SRSF7Q16629 PCMTD2-203ENST00000308824 3843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.965e-6■■■■□ 24.7
SRSF7Q16629 PCMTD2-209ENST00000609818 551 ntTSL 45.36□□□□□ -1.555e-6■■■■□ 24.7
SRSF7Q16629 SYNJ2-205ENST00000449320 680 ntTSL 46.74□□□□□ -1.332e-7■■■■□ 24.6
SRSF7Q16629 SYNJ2-203ENST00000367113 939 ntTSL 26.31□□□□□ -1.42e-7■■■■□ 24.6
SRSF7Q16629 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.152e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.022e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 ATP6V0D1-211ENST00000565835 905 ntTSL 314.18□□□□□ -0.142e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.152e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 MSH5-SAPCD1-208ENST00000498473 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)13.78□□□□□ -0.22e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.252e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 ATP6V0D1-207ENST00000563305 1656 ntTSL 513.4□□□□□ -0.262e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.282e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 MSH5-SAPCD1-206ENST00000491552 706 ntTSL 313.04□□□□□ -0.322e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.372e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 MSH5-208ENST00000429846 616 ntTSL 311.43□□□□□ -0.582e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 ATP6V0D1-218ENST00000602876 1554 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.62e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.632e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.632e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 AGPAT3-207ENST00000445582 582 ntTSL 310.35□□□□□ -0.752e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 AGPAT3-208ENST00000448287 454 ntTSL 310.28□□□□□ -0.762e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 ATP6V0D1-217ENST00000568620 3390 ntTSL 29.91□□□□□ -0.822e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 MSH5-216ENST00000484309 857 ntTSL 59.59□□□□□ -0.872e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 DYNC1LI2-208ENST00000564833 727 ntTSL 49.08□□□□□ -0.962e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 DYNC1LI2-209ENST00000565532 744 ntTSL 58.95□□□□□ -0.982e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 NAP1L1-215ENST00000549479 573 ntTSL 28.92□□□□□ -0.982e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 ATP6V0D1-202ENST00000426604 1257 ntTSL 28.81□□□□□ -12e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 MSH5-205ENST00000395853 2704 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.162e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 NAP1L1-207ENST00000547479 623 ntTSL 57.39□□□□□ -1.232e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 DYNC1LI2-211ENST00000567499 3994 ntTSL 25.95□□□□□ -1.462e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 LINC00534-202ENST00000523283 772 ntTSL 25.43□□□□□ -1.542e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 LINC00534-203ENST00000523406 812 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.542e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 LINC00534-204ENST00000524361 620 ntTSL 34.77□□□□□ -1.652e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.672e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 SNHG8-204ENST00000602573 570 ntTSL 24.51□□□□□ -1.692e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 SAP30BP-212ENST00000580322 1558 ntTSL 519.26■□□□□ 0.679e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 SAP30BP-213ENST00000580484 686 ntTSL 315.52■□□□□ 0.089e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 SAP30BP-226ENST00000584861 579 ntTSL 213.6□□□□□ -0.239e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 SAP30BP-201ENST00000293208 1272 ntTSL 513.23□□□□□ -0.299e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 SAP30BP-221ENST00000583536 1000 ntTSL 312.91□□□□□ -0.349e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 SAP30BP-219ENST00000583170 553 ntTSL 412.91□□□□□ -0.349e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 SAP30BP-204ENST00000577292 1097 ntTSL 212.91□□□□□ -0.349e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 SAP30BP-217ENST00000582022 2409 ntTSL 1 (best)12.84□□□□□ -0.359e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 SAP30BP-205ENST00000578288 870 ntTSL 1 (best)12.13□□□□□ -0.479e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 SAP30BP-211ENST00000579877 561 ntTSL 211.91□□□□□ -0.59e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.539e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 SAP30BP-222ENST00000583737 525 ntTSL 411.5□□□□□ -0.579e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 SAP30BP-225ENST00000584667 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.589e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 SAP30BP-203ENST00000542343 1011 ntTSL 28.48□□□□□ -1.059e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 SAP30BP-208ENST00000578909 678 ntTSL 57.97□□□□□ -1.139e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 SAP30BP-206ENST00000578354 574 ntTSL 46.49□□□□□ -1.379e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 SAP30BP-210ENST00000579864 868 ntTSL 35.85□□□□□ -1.479e-7■■■■□ 24.5
SRSF7Q16629 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.419e-7■■■■□ 24.4
SRSF7Q16629 PPARGC1A-217ENST00000613098 3210 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.393e-9■■■■□ 24.4
SRSF7Q16629 PPARGC1A-209ENST00000509702 2704 ntTSL 55.22□□□□□ -1.573e-9■■■■□ 24.4
SRSF7Q16629 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.683e-9■■■■□ 24.4
SRSF7Q16629 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.465e-12■■■■□ 24.4
SRSF7Q16629 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.232e-7■■■■□ 24.3
SRSF7Q16629 ATP11A-206ENST00000419631 2446 ntTSL 311.09□□□□□ -0.632e-7■■■■□ 24.3
SRSF7Q16629 ATP11A-210ENST00000471555 5786 ntTSL 1 (best)9.32□□□□□ -0.922e-7■■■■□ 24.3
SRSF7Q16629 L3MBTL1-205ENST00000422861 4322 ntAPPRIS ALT2 TSL 27.76□□□□□ -1.172e-7■■■■□ 24.3
SRSF7Q16629 Z98752.3-201ENST00000621802 566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.272e-7■■■■□ 24.3
SRSF7Q16629 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.68e-7■■■■□ 24.3
SRSF7Q16629 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.48e-7■■■■□ 24.3
SRSF7Q16629 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.398e-7■■■■□ 24.3
SRSF7Q16629 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.338e-7■■■■□ 24.3
SRSF7Q16629 ZGPAT-208ENST00000472711 787 ntTSL 315.94■□□□□ 0.148e-7■■■■□ 24.3
SRSF7Q16629 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.138e-7■■■■□ 24.3
SRSF7Q16629 ZGPAT-207ENST00000468235 594 ntTSL 1 (best)14.05□□□□□ -0.168e-7■■■■□ 24.3
SRSF7Q16629 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.268e-7■■■■□ 24.3
SRSF7Q16629 ZGPAT-209ENST00000477340 2831 ntTSL 213.33□□□□□ -0.288e-7■■■■□ 24.3
SRSF7Q16629 ZGPAT-210ENST00000478385 935 ntTSL 213.23□□□□□ -0.298e-7■■■■□ 24.3
SRSF7Q16629 FOXN3-211ENST00000555855 851 ntTSL 515.02■□□□□ -02e-6■■■■□ 24.2
SRSF7Q16629 ACOX2-213ENST00000492530 578 ntTSL 312.32□□□□□ -0.442e-6■■■■□ 24.2
SRSF7Q16629 ACOX2-208ENST00000474098 708 ntTSL 311.88□□□□□ -0.512e-6■■■■□ 24.2
SRSF7Q16629 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.562e-6■■■■□ 24.2
SRSF7Q16629 ACOX2-201ENST00000302819 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.612e-6■■■■□ 24.2
SRSF7Q16629 TRO-202ENST00000319167 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.632e-6■■■■□ 24.2
SRSF7Q16629 TRO-203ENST00000375022 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.632e-6■■■■□ 24.2
SRSF7Q16629 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.692e-6■■■■□ 24.2
SRSF7Q16629 TRO-215ENST00000445561 2597 ntTSL 1 (best)10.74□□□□□ -0.692e-6■■■■□ 24.2
SRSF7Q16629 TRO-224ENST00000492706 3677 ntTSL 210.12□□□□□ -0.792e-6■■■■□ 24.2
SRSF7Q16629 TRO-221ENST00000475183 632 ntTSL 310.09□□□□□ -0.792e-6■■■■□ 24.2
SRSF7Q16629 TRO-201ENST00000173898 4647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.812e-6■■■■□ 24.2
SRSF7Q16629 RBM5-211ENST00000462025 573 ntTSL 49.4□□□□□ -0.92e-6■■■■□ 24.2
SRSF7Q16629 ACOX2-202ENST00000459701 2348 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.972e-6■■■■□ 24.2
SRSF7Q16629 TRO-204ENST00000375041 3488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.062e-6■■■■□ 24.2
SRSF7Q16629 ACOX2-209ENST00000475143 426 ntTSL 58.25□□□□□ -1.092e-6■■■■□ 24.2
SRSF7Q16629 TRO-208ENST00000420798 3613 ntTSL 2 BASIC8.15□□□□□ -1.112e-6■■■■□ 24.2
SRSF7Q16629 RBM5-226ENST00000496179 1406 ntTSL 58.03□□□□□ -1.122e-6■■■■□ 24.2
SRSF7Q16629 TRO-219ENST00000469211 842 ntTSL 28□□□□□ -1.132e-6■■■■□ 24.2
SRSF7Q16629 AL137230.2-201ENST00000555070 452 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.162e-6■■■■□ 24.2
SRSF7Q16629 RBM5-201ENST00000347869 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.222e-6■■■■□ 24.2
SRSF7Q16629 RBM5-212ENST00000464087 5616 ntTSL 26.82□□□□□ -1.322e-6■■■■□ 24.2
SRSF7Q16629 RBM5-215ENST00000471995 762 ntTSL 36.77□□□□□ -1.332e-6■■■■□ 24.2
SRSF7Q16629 RBM5-202ENST00000395174 938 ntTSL 35.83□□□□□ -1.482e-6■■■■□ 24.2
Retrieved 100 of 5,030 protein–RNA pairs in 168.4 ms