Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZIC1Q15915 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZIC1Q15915 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ZIC1Q15915 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZIC1Q15915 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZIC1Q15915 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZIC1Q15915 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZIC1Q15915 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZIC1Q15915 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZIC1Q15915 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZIC1Q15915 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZIC1Q15915 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZIC1Q15915 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZIC1Q15915 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ZIC1Q15915 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ZIC1Q15915 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ZIC1Q15915 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ZIC1Q15915 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ZIC1Q15915 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ZIC1Q15915 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ZIC1Q15915 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ZIC1Q15915 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ZIC1Q15915 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ZIC1Q15915 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZIC1Q15915 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZIC1Q15915 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZIC1Q15915 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZIC1Q15915 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZIC1Q15915 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZIC1Q15915 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZIC1Q15915 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZIC1Q15915 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZIC1Q15915 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZIC1Q15915 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZIC1Q15915 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZIC1Q15915 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ZIC1Q15915 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZIC1Q15915 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZIC1Q15915 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZIC1Q15915 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZIC1Q15915 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZIC1Q15915 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZIC1Q15915 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZIC1Q15915 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZIC1Q15915 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZIC1Q15915 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZIC1Q15915 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZIC1Q15915 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZIC1Q15915 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZIC1Q15915 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZIC1Q15915 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZIC1Q15915 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ZIC1Q15915 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZIC1Q15915 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZIC1Q15915 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZIC1Q15915 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZIC1Q15915 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZIC1Q15915 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZIC1Q15915 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZIC1Q15915 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZIC1Q15915 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZIC1Q15915 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ZIC1Q15915 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZIC1Q15915 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZIC1Q15915 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZIC1Q15915 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZIC1Q15915 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZIC1Q15915 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZIC1Q15915 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZIC1Q15915 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZIC1Q15915 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZIC1Q15915 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZIC1Q15915 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZIC1Q15915 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZIC1Q15915 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZIC1Q15915 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZIC1Q15915 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZIC1Q15915 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZIC1Q15915 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZIC1Q15915 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZIC1Q15915 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZIC1Q15915 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ZIC1Q15915 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZIC1Q15915 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZIC1Q15915 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZIC1Q15915 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZIC1Q15915 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZIC1Q15915 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZIC1Q15915 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZIC1Q15915 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZIC1Q15915 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZIC1Q15915 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ZIC1Q15915 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZIC1Q15915 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZIC1Q15915 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZIC1Q15915 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZIC1Q15915 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZIC1Q15915 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZIC1Q15915 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZIC1Q15915 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms