Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCM1Q15154 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCM1Q15154 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCM1Q15154 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCM1Q15154 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCM1Q15154 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCM1Q15154 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCM1Q15154 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
PCM1Q15154 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PCM1Q15154 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCM1Q15154 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCM1Q15154 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCM1Q15154 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCM1Q15154 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCM1Q15154 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCM1Q15154 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PCM1Q15154 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCM1Q15154 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCM1Q15154 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCM1Q15154 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCM1Q15154 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCM1Q15154 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCM1Q15154 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCM1Q15154 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCM1Q15154 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCM1Q15154 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCM1Q15154 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCM1Q15154 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCM1Q15154 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PCM1Q15154 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PCM1Q15154 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCM1Q15154 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCM1Q15154 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCM1Q15154 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCM1Q15154 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCM1Q15154 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCM1Q15154 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCM1Q15154 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PCM1Q15154 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCM1Q15154 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCM1Q15154 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCM1Q15154 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCM1Q15154 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCM1Q15154 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCM1Q15154 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCM1Q15154 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCM1Q15154 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PCM1Q15154 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCM1Q15154 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCM1Q15154 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PCM1Q15154 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCM1Q15154 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCM1Q15154 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCM1Q15154 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCM1Q15154 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCM1Q15154 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCM1Q15154 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCM1Q15154 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCM1Q15154 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCM1Q15154 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCM1Q15154 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCM1Q15154 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCM1Q15154 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCM1Q15154 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCM1Q15154 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCM1Q15154 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCM1Q15154 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCM1Q15154 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCM1Q15154 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCM1Q15154 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCM1Q15154 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCM1Q15154 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PCM1Q15154 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCM1Q15154 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCM1Q15154 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCM1Q15154 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCM1Q15154 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCM1Q15154 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCM1Q15154 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCM1Q15154 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCM1Q15154 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCM1Q15154 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCM1Q15154 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCM1Q15154 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCM1Q15154 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCM1Q15154 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCM1Q15154 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCM1Q15154 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCM1Q15154 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCM1Q15154 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCM1Q15154 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCM1Q15154 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCM1Q15154 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCM1Q15154 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCM1Q15154 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCM1Q15154 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PCM1Q15154 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCM1Q15154 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCM1Q15154 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCM1Q15154 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
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