Protein–RNA interactions for Protein: Q13496

MTM1, Myotubularin, humanhuman

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Length 603 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTM1Q13496 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MTM1Q13496 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MTM1Q13496 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MTM1Q13496 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MTM1Q13496 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MTM1Q13496 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MTM1Q13496 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MTM1Q13496 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MTM1Q13496 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MTM1Q13496 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MTM1Q13496 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MTM1Q13496 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MTM1Q13496 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MTM1Q13496 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MTM1Q13496 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MTM1Q13496 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MTM1Q13496 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MTM1Q13496 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MTM1Q13496 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MTM1Q13496 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
MTM1Q13496 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MTM1Q13496 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MTM1Q13496 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MTM1Q13496 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MTM1Q13496 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
MTM1Q13496 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MTM1Q13496 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MTM1Q13496 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MTM1Q13496 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MTM1Q13496 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MTM1Q13496 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MTM1Q13496 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
MTM1Q13496 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MTM1Q13496 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MTM1Q13496 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MTM1Q13496 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MTM1Q13496 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MTM1Q13496 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MTM1Q13496 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MTM1Q13496 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MTM1Q13496 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MTM1Q13496 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MTM1Q13496 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MTM1Q13496 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MTM1Q13496 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MTM1Q13496 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MTM1Q13496 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MTM1Q13496 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MTM1Q13496 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MTM1Q13496 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MTM1Q13496 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MTM1Q13496 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MTM1Q13496 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MTM1Q13496 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MTM1Q13496 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
MTM1Q13496 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MTM1Q13496 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MTM1Q13496 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MTM1Q13496 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MTM1Q13496 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
MTM1Q13496 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
MTM1Q13496 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
MTM1Q13496 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MTM1Q13496 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MTM1Q13496 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MTM1Q13496 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MTM1Q13496 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MTM1Q13496 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MTM1Q13496 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MTM1Q13496 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MTM1Q13496 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MTM1Q13496 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MTM1Q13496 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MTM1Q13496 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MTM1Q13496 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MTM1Q13496 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MTM1Q13496 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MTM1Q13496 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MTM1Q13496 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MTM1Q13496 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MTM1Q13496 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MTM1Q13496 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MTM1Q13496 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MTM1Q13496 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MTM1Q13496 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MTM1Q13496 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MTM1Q13496 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MTM1Q13496 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MTM1Q13496 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MTM1Q13496 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MTM1Q13496 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MTM1Q13496 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MTM1Q13496 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MTM1Q13496 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
MTM1Q13496 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MTM1Q13496 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MTM1Q13496 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
MTM1Q13496 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MTM1Q13496 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MTM1Q13496 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
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