Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STX4Q12846 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STX4Q12846 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STX4Q12846 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STX4Q12846 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
STX4Q12846 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STX4Q12846 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STX4Q12846 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
STX4Q12846 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STX4Q12846 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
STX4Q12846 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
STX4Q12846 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
STX4Q12846 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
STX4Q12846 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
STX4Q12846 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
STX4Q12846 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
STX4Q12846 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
STX4Q12846 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
STX4Q12846 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
STX4Q12846 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
STX4Q12846 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
STX4Q12846 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
STX4Q12846 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
STX4Q12846 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
STX4Q12846 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
STX4Q12846 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
STX4Q12846 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
STX4Q12846 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
STX4Q12846 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
STX4Q12846 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
STX4Q12846 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
STX4Q12846 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
STX4Q12846 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
STX4Q12846 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
STX4Q12846 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
STX4Q12846 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
STX4Q12846 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
STX4Q12846 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
STX4Q12846 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
STX4Q12846 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
STX4Q12846 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
STX4Q12846 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
STX4Q12846 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
STX4Q12846 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
STX4Q12846 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
STX4Q12846 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
STX4Q12846 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
STX4Q12846 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
STX4Q12846 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STX4Q12846 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STX4Q12846 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
STX4Q12846 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
STX4Q12846 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STX4Q12846 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STX4Q12846 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
STX4Q12846 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
STX4Q12846 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
STX4Q12846 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STX4Q12846 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STX4Q12846 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STX4Q12846 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
STX4Q12846 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
STX4Q12846 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
STX4Q12846 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
STX4Q12846 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
STX4Q12846 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STX4Q12846 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STX4Q12846 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STX4Q12846 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
STX4Q12846 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
STX4Q12846 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
STX4Q12846 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
STX4Q12846 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
STX4Q12846 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
STX4Q12846 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
STX4Q12846 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
STX4Q12846 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
STX4Q12846 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
STX4Q12846 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
STX4Q12846 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
STX4Q12846 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
STX4Q12846 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
STX4Q12846 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
STX4Q12846 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
STX4Q12846 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
STX4Q12846 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
STX4Q12846 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
STX4Q12846 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
STX4Q12846 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
STX4Q12846 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
STX4Q12846 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
STX4Q12846 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
STX4Q12846 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
STX4Q12846 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
STX4Q12846 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
STX4Q12846 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
STX4Q12846 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
STX4Q12846 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
STX4Q12846 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
STX4Q12846 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
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