Protein–RNA interactions for Protein: Q12504

RKM4, Ribosomal lysine N-methyltransferase 4, yeastyeast

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RKM4Q12504 YTH1YPR107C 627 nt9.05□□□□□ -0.96
RKM4Q12504 OCH1YGL038C 1443 nt9.05□□□□□ -0.96
RKM4Q12504 RPC31YNL151C 756 nt9.04□□□□□ -0.96
RKM4Q12504 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt9.03□□□□□ -0.96
RKM4Q12504 YRF1-2YER190W 5046 nt9.02□□□□□ -0.97
RKM4Q12504 ELP4YPL101W 1371 nt9.02□□□□□ -0.97
RKM4Q12504 MFT1YML062C 1179 nt9.02□□□□□ -0.97
RKM4Q12504 MET22YOL064C 1074 nt9.01□□□□□ -0.97
RKM4Q12504 YRF1-3YGR296W 5580 nt9□□□□□ -0.97
RKM4Q12504 YRF1-6YNL339C 5580 nt9□□□□□ -0.97
RKM4Q12504 YRF1-7YPL283C 5580 nt9□□□□□ -0.97
RKM4Q12504 DPL1YDR294C 1770 nt9□□□□□ -0.97
RKM4Q12504 MDM35YKL053C-A 261 nt8.99□□□□□ -0.97
RKM4Q12504 PAM17YKR065C 594 nt8.99□□□□□ -0.97
RKM4Q12504 YLR460CYLR460C 1131 nt8.99□□□□□ -0.97
RKM4Q12504 PDC6YGR087C 1692 nt8.99□□□□□ -0.97
RKM4Q12504 CHS7YHR142W 951 nt8.98□□□□□ -0.97
RKM4Q12504 YJR149WYJR149W 1215 nt8.98□□□□□ -0.97
RKM4Q12504 RNA170RNA170 169 nt8.98□□□□□ -0.97
RKM4Q12504 YMR206WYMR206W 942 nt8.98□□□□□ -0.97
RKM4Q12504 DMA2YNL116W 1569 nt8.98□□□□□ -0.97
RKM4Q12504 ADE1YAR015W 921 nt8.97□□□□□ -0.97
RKM4Q12504 THI3YDL080C 1830 nt8.96□□□□□ -0.97
RKM4Q12504 BXI1YNL305C 894 nt8.96□□□□□ -0.98
RKM4Q12504 GGA2YHR108W 1758 nt8.96□□□□□ -0.98
RKM4Q12504 MTO1YGL236C 2010 nt8.95□□□□□ -0.98
RKM4Q12504 ATP2YJR121W 1536 nt8.95□□□□□ -0.98
RKM4Q12504 FAF1YIL019W 1041 nt8.94□□□□□ -0.98
RKM4Q12504 RPS6AYPL090C 711 nt8.94□□□□□ -0.98
RKM4Q12504 RPS6BYBR181C 711 nt8.94□□□□□ -0.98
RKM4Q12504 HXK1YFR053C 1458 nt8.94□□□□□ -0.98
RKM4Q12504 TOM71YHR117W 1920 nt8.93□□□□□ -0.98
RKM4Q12504 KAE1YKR038C 1161 nt8.93□□□□□ -0.98
RKM4Q12504 FUS3YBL016W 1062 nt8.93□□□□□ -0.98
RKM4Q12504 TPN1YGL186C 1740 nt8.92□□□□□ -0.98
RKM4Q12504 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt8.91□□□□□ -0.98
RKM4Q12504 NSG2YNL156C 900 nt8.91□□□□□ -0.98
RKM4Q12504 YHL008CYHL008C 1884 nt8.91□□□□□ -0.98
RKM4Q12504 YDR306CYDR306C 1437 nt8.9□□□□□ -0.98
RKM4Q12504 NUP53YMR153W 1428 nt8.9□□□□□ -0.98
RKM4Q12504 YPR084WYPR084W 1371 nt8.9□□□□□ -0.98
RKM4Q12504 LEU4YNL104C 1860 nt8.9□□□□□ -0.98
RKM4Q12504 YIR035CYIR035C 765 nt8.9□□□□□ -0.98
RKM4Q12504 PSD1YNL169C 1503 nt8.9□□□□□ -0.99
RKM4Q12504 YDR467CYDR467C 327 nt8.89□□□□□ -0.99
RKM4Q12504 TDH1YJL052W 999 nt8.89□□□□□ -0.99
RKM4Q12504 AAC3YBR085W 924 nt8.89□□□□□ -0.99
RKM4Q12504 TMS1YDR105C 1422 nt8.88□□□□□ -0.99
RKM4Q12504 HXT10YFL011W 1641 nt8.88□□□□□ -0.99
RKM4Q12504 TOS1YBR162C 1368 nt8.87□□□□□ -0.99
RKM4Q12504 YLR173WYLR173W 1827 nt8.87□□□□□ -0.99
RKM4Q12504 HOG1YLR113W 1308 nt8.87□□□□□ -0.99
RKM4Q12504 GPM1YKL152C 744 nt8.87□□□□□ -0.99
RKM4Q12504 PUS5YLR165C 765 nt8.87□□□□□ -0.99
RKM4Q12504 OLA1YBR025C 1185 nt8.87□□□□□ -0.99
RKM4Q12504 ALD5YER073W 1563 nt8.86□□□□□ -0.99
RKM4Q12504 YJL043WYJL043W 774 nt8.86□□□□□ -0.99
RKM4Q12504 CYT1YOR065W 930 nt8.86□□□□□ -0.99
RKM4Q12504 BAP3YDR046C 1815 nt8.85□□□□□ -0.99
RKM4Q12504 PUS7YOR243C 2031 nt8.84□□□□□ -0.99
RKM4Q12504 YHR218WYHR218W 1812 nt8.83□□□□□ -1
RKM4Q12504 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt8.83□□□□□ -1
RKM4Q12504 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt8.83□□□□□ -1
RKM4Q12504 BNS1YGR230W 414 nt8.82□□□□□ -1
RKM4Q12504 PET494YNR045W 1470 nt8.82□□□□□ -1
RKM4Q12504 INH1YDL181W 258 nt8.81□□□□□ -1
RKM4Q12504 FHN1YGR131W 525 nt8.8□□□□□ -1
RKM4Q12504 BUB2YMR055C 921 nt8.8□□□□□ -1
RKM4Q12504 REC114YMR133W 1287 nt8.8□□□□□ -1
RKM4Q12504 PRE5YMR314W 705 nt8.8□□□□□ -1
RKM4Q12504 AGP3YFL055W 1677 nt8.8□□□□□ -1
RKM4Q12504 YPT31YER031C 672 nt8.79□□□□□ -1
RKM4Q12504 PUP3YER094C 618 nt8.79□□□□□ -1
RKM4Q12504 RHO1YPR165W 630 nt8.79□□□□□ -1
RKM4Q12504 THI6YPL214C 1623 nt8.79□□□□□ -1
RKM4Q12504 YBR056WYBR056W 1506 nt8.79□□□□□ -1
RKM4Q12504 ALR1YOL130W 2580 nt8.78□□□□□ -1
RKM4Q12504 YHM2YMR241W 945 nt8.78□□□□□ -1
RKM4Q12504 KDX1YKL161C 1302 nt8.78□□□□□ -1
RKM4Q12504 YBL095WYBL095W 813 nt8.77□□□□□ -1.01
RKM4Q12504 NPP2YEL016C 1482 nt8.77□□□□□ -1.01
RKM4Q12504 RTG2YGL252C 1767 nt8.76□□□□□ -1.01
RKM4Q12504 YIL168WYIL168W 384 nt8.76□□□□□ -1.01
RKM4Q12504 YMC2YBR104W 990 nt8.76□□□□□ -1.01
RKM4Q12504 YPL247CYPL247C 1572 nt8.76□□□□□ -1.01
RKM4Q12504 SHC1YER096W 1539 nt8.75□□□□□ -1.01
RKM4Q12504 PMU1YKL128C 888 nt8.75□□□□□ -1.01
RKM4Q12504 TIM50YPL063W 1431 nt8.74□□□□□ -1.01
RKM4Q12504 PSP2YML017W 1782 nt8.73□□□□□ -1.01
RKM4Q12504 ATG17YLR423C 1254 nt8.73□□□□□ -1.01
RKM4Q12504 DUR3YHL016C 2208 nt8.72□□□□□ -1.01
RKM4Q12504 YDR476CYDR476C 675 nt8.71□□□□□ -1.02
RKM4Q12504 GNP1YDR508C 1992 nt8.71□□□□□ -1.02
RKM4Q12504 JHD1YER051W 1479 nt8.7□□□□□ -1.02
RKM4Q12504 GCD11YER025W 1584 nt8.7□□□□□ -1.02
RKM4Q12504 YIL177CYIL177C 5277 nt8.7□□□□□ -1.02
RKM4Q12504 MRS4YKR052C 915 nt8.7□□□□□ -1.02
RKM4Q12504 THI73YLR004C 1572 nt8.69□□□□□ -1.02
RKM4Q12504 RRT6YGL146C 936 nt8.68□□□□□ -1.02
RKM4Q12504 SDH8YBR269C 417 nt8.68□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 131.5 ms