Protein–RNA interactions for Protein: Q12266

TY1A-BL, Transposon Ty1-BL Gag polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-BLQ12266 MAE1YKL029C 2010 nt8.32□□□□□ -1.08
TY1A-BLQ12266 CCT2YIL142W 1584 nt8.32□□□□□ -1.08
TY1A-BLQ12266 VAC17YCL063W 1272 nt8.32□□□□□ -1.08
TY1A-BLQ12266 YCR049CYCR049C 447 nt8.32□□□□□ -1.08
TY1A-BLQ12266 YAP6YDR259C 1152 nt8.32□□□□□ -1.08
TY1A-BLQ12266 HIS2YFR025C 1008 nt8.32□□□□□ -1.08
TY1A-BLQ12266 YFR045WYFR045W 930 nt8.32□□□□□ -1.08
TY1A-BLQ12266 YBL029C-AYBL029C-A 285 nt8.32□□□□□ -1.08
TY1A-BLQ12266 PGC1YPL206C 966 nt8.32□□□□□ -1.08
TY1A-BLQ12266 UGA4YDL210W 1716 nt8.32□□□□□ -1.08
TY1A-BLQ12266 UGP1YKL035W 1500 nt8.31□□□□□ -1.08
TY1A-BLQ12266 YMR103CYMR103C 363 nt8.31□□□□□ -1.08
TY1A-BLQ12266 YPR027CYPR027C 834 nt8.31□□□□□ -1.08
TY1A-BLQ12266 ESC2YDR363W 1371 nt8.31□□□□□ -1.08
TY1A-BLQ12266 ARO8YGL202W 1503 nt8.3□□□□□ -1.08
TY1A-BLQ12266 CDA2YLR308W 939 nt8.3□□□□□ -1.08
TY1A-BLQ12266 YMR244WYMR244W 1068 nt8.3□□□□□ -1.08
TY1A-BLQ12266 RTC4YNL254C 1206 nt8.3□□□□□ -1.08
TY1A-BLQ12266 ARL3YPL051W 597 nt8.3□□□□□ -1.08
TY1A-BLQ12266 GND2YGR256W 1479 nt8.3□□□□□ -1.08
TY1A-BLQ12266 MEP3YPR138C 1470 nt8.3□□□□□ -1.08
TY1A-BLQ12266 RAD23YEL037C 1197 nt8.29□□□□□ -1.08
TY1A-BLQ12266 MRPL24YMR193W 777 nt8.29□□□□□ -1.08
TY1A-BLQ12266 SLZ1YNL196C 897 nt8.29□□□□□ -1.08
TY1A-BLQ12266 OYE3YPL171C 1203 nt8.29□□□□□ -1.08
TY1A-BLQ12266 LSB5YCL034W 1065 nt8.29□□□□□ -1.08
TY1A-BLQ12266 MET2YNL277W 1461 nt8.29□□□□□ -1.08
TY1A-BLQ12266 YMR209CYMR209C 1374 nt8.28□□□□□ -1.08
TY1A-BLQ12266 snR56snR56 88 nt8.28□□□□□ -1.08
TY1A-BLQ12266 RRT6YGL146C 936 nt8.28□□□□□ -1.08
TY1A-BLQ12266 TRT2tT(CGU)K 72 nt8.28□□□□□ -1.08
TY1A-BLQ12266 OAC1YKL120W 975 nt8.28□□□□□ -1.08
TY1A-BLQ12266 YLR407WYLR407W 687 nt8.28□□□□□ -1.08
TY1A-BLQ12266 SPR1YOR190W 1338 nt8.28□□□□□ -1.08
TY1A-BLQ12266 KES1YPL145C 1305 nt8.28□□□□□ -1.08
TY1A-BLQ12266 FRE6YLL051C 2139 nt8.27□□□□□ -1.08
TY1A-BLQ12266 SEC28YIL076W 891 nt8.27□□□□□ -1.09
TY1A-BLQ12266 PET8YNL003C 855 nt8.27□□□□□ -1.09
TY1A-BLQ12266 SSP2YOR242C 1116 nt8.27□□□□□ -1.09
TY1A-BLQ12266 GCV1YDR019C 1203 nt8.26□□□□□ -1.09
TY1A-BLQ12266 ADD66YKL206C 804 nt8.26□□□□□ -1.09
TY1A-BLQ12266 YLR202CYLR202C 327 nt8.26□□□□□ -1.09
TY1A-BLQ12266 COG5YNL051W 1212 nt8.26□□□□□ -1.09
TY1A-BLQ12266 SET6YPL165C 1122 nt8.26□□□□□ -1.09
TY1A-BLQ12266 FCY21YER060W 1587 nt8.26□□□□□ -1.09
TY1A-BLQ12266 SGA1YIL099W 1650 nt8.25□□□□□ -1.09
TY1A-BLQ12266 YER138W-AYER138W-A 105 nt8.25□□□□□ -1.09
TY1A-BLQ12266 SAW1YAL027W 786 nt8.25□□□□□ -1.09
TY1A-BLQ12266 YBL107W-AYBL107W-A 105 nt8.25□□□□□ -1.09
TY1A-BLQ12266 LSB6YJL100W 1824 nt8.24□□□□□ -1.09
TY1A-BLQ12266 YDR220CYDR220C 294 nt8.24□□□□□ -1.09
TY1A-BLQ12266 BET2YPR176C 978 nt8.24□□□□□ -1.09
TY1A-BLQ12266 DDI1YER143W 1287 nt8.23□□□□□ -1.09
TY1A-BLQ12266 COG7YGL005C 840 nt8.23□□□□□ -1.09
TY1A-BLQ12266 ARG3YJL088W 1017 nt8.23□□□□□ -1.09
TY1A-BLQ12266 ATP12YJL180C 978 nt8.23□□□□□ -1.09
TY1A-BLQ12266 POP5YAL033W 522 nt8.23□□□□□ -1.09
TY1A-BLQ12266 YLR111WYLR111W 333 nt8.23□□□□□ -1.09
TY1A-BLQ12266 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt8.23□□□□□ -1.09
TY1A-BLQ12266 IBD2YNL164C 1056 nt8.23□□□□□ -1.09
TY1A-BLQ12266 BAG7YOR134W 1230 nt8.23□□□□□ -1.09
TY1A-BLQ12266 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt8.23□□□□□ -1.09
TY1A-BLQ12266 RSC4YKR008W 1878 nt8.23□□□□□ -1.09
TY1A-BLQ12266 RIB3YDR487C 627 nt8.22□□□□□ -1.09
TY1A-BLQ12266 TCA17YEL048C 459 nt8.22□□□□□ -1.09
TY1A-BLQ12266 COS6YGR295C 1146 nt8.22□□□□□ -1.09
TY1A-BLQ12266 AIM2YAL049C 741 nt8.22□□□□□ -1.09
TY1A-BLQ12266 THI80YOR143C 960 nt8.22□□□□□ -1.09
TY1A-BLQ12266 ESBP6YNL125C 2022 nt8.21□□□□□ -1.1
TY1A-BLQ12266 PPH22YDL188C 1134 nt8.21□□□□□ -1.1
TY1A-BLQ12266 YFL019CYFL019C 354 nt8.21□□□□□ -1.1
TY1A-BLQ12266 COX11YPL132W 903 nt8.21□□□□□ -1.1
TY1A-BLQ12266 RXT2YBR095C 1293 nt8.21□□□□□ -1.1
TY1A-BLQ12266 ACO2YJL200C 2370 nt8.21□□□□□ -1.1
TY1A-BLQ12266 KAR1YNL188W 1302 nt8.21□□□□□ -1.1
TY1A-BLQ12266 FLR1YBR008C 1647 nt8.21□□□□□ -1.1
TY1A-BLQ12266 FMS1YMR020W 1527 nt8.2□□□□□ -1.1
TY1A-BLQ12266 ACH1YBL015W 1581 nt8.2□□□□□ -1.1
TY1A-BLQ12266 APT2YDR441C 546 nt8.2□□□□□ -1.1
TY1A-BLQ12266 OKP1YGR179C 1221 nt8.2□□□□□ -1.1
TY1A-BLQ12266 SPC42YKL042W 1092 nt8.2□□□□□ -1.1
TY1A-BLQ12266 YNL171CYNL171C 369 nt8.2□□□□□ -1.1
TY1A-BLQ12266 SPP2YOR148C 558 nt8.2□□□□□ -1.1
TY1A-BLQ12266 GFD1YMR255W 567 nt8.19□□□□□ -1.1
TY1A-BLQ12266 YOL079WYOL079W 399 nt8.19□□□□□ -1.1
TY1A-BLQ12266 PCI8YIL071C 1335 nt8.19□□□□□ -1.1
TY1A-BLQ12266 RSC8YFR037C 1674 nt8.18□□□□□ -1.1
TY1A-BLQ12266 MED2YDL005C 1296 nt8.18□□□□□ -1.1
TY1A-BLQ12266 YDR161WYDR161W 1164 nt8.18□□□□□ -1.1
TY1A-BLQ12266 TDH1YJL052W 999 nt8.18□□□□□ -1.1
TY1A-BLQ12266 YMR226CYMR226C 804 nt8.18□□□□□ -1.1
TY1A-BLQ12266 ZAP1YJL056C 2643 nt8.18□□□□□ -1.1
TY1A-BLQ12266 NPL6YMR091C 1308 nt8.18□□□□□ -1.1
TY1A-BLQ12266 PRY1YJL079C 900 nt8.17□□□□□ -1.1
TY1A-BLQ12266 YJR115WYJR115W 510 nt8.17□□□□□ -1.1
TY1A-BLQ12266 SMM1YNR015W 1155 nt8.17□□□□□ -1.1
TY1A-BLQ12266 BNI5YNL166C 1347 nt8.17□□□□□ -1.1
TY1A-BLQ12266 NBP2YDR162C 711 nt8.16□□□□□ -1.1
TY1A-BLQ12266 SAM2YDR502C 1155 nt8.16□□□□□ -1.1
TY1A-BLQ12266 OXA1YER154W 1209 nt8.16□□□□□ -1.1
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