Protein–RNA interactions for Protein: Q12244

YLL054C, Uncharacterized transcriptional regulatory protein YLL054C, yeastyeast

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLL054CQ12244 YNR064CYNR064C 873 nt8.34□□□□□ -1.07
YLL054CQ12244 TVP23YDR084C 600 nt8.33□□□□□ -1.08
YLL054CQ12244 PAU15YIR041W 375 nt8.33□□□□□ -1.08
YLL054CQ12244 YJL211CYJL211C 444 nt8.33□□□□□ -1.08
YLL054CQ12244 ATP10YLR393W 840 nt8.33□□□□□ -1.08
YLL054CQ12244 YBL081WYBL081W 1107 nt8.33□□□□□ -1.08
YLL054CQ12244 MAS2YHR024C 1449 nt8.32□□□□□ -1.08
YLL054CQ12244 INH1YDL181W 258 nt8.32□□□□□ -1.08
YLL054CQ12244 RAD51YER095W 1203 nt8.32□□□□□ -1.08
YLL054CQ12244 MRPL36YBR122C 534 nt8.32□□□□□ -1.08
YLL054CQ12244 PCL10YGL134W 1302 nt8.31□□□□□ -1.08
YLL054CQ12244 OPI3YJR073C 621 nt8.31□□□□□ -1.08
YLL054CQ12244 SNX3YOR357C 489 nt8.31□□□□□ -1.08
YLL054CQ12244 BNA3YJL060W 1335 nt8.3□□□□□ -1.08
YLL054CQ12244 GET2YER083C 858 nt8.3□□□□□ -1.08
YLL054CQ12244 COX16YJL003W 357 nt8.3□□□□□ -1.08
YLL054CQ12244 snR4snR4 186 nt8.3□□□□□ -1.08
YLL054CQ12244 NPP2YEL016C 1482 nt8.3□□□□□ -1.08
YLL054CQ12244 YIL177CYIL177C 5277 nt8.3□□□□□ -1.08
YLL054CQ12244 CDC13YDL220C 2775 nt8.29□□□□□ -1.08
YLL054CQ12244 OCA1YNL099C 717 nt8.29□□□□□ -1.08
YLL054CQ12244 HEL1YKR017C 1656 nt8.29□□□□□ -1.08
YLL054CQ12244 YCR061WYCR061W 1896 nt8.29□□□□□ -1.08
YLL054CQ12244 YRF1-1YDR545W 5391 nt8.29□□□□□ -1.08
YLL054CQ12244 YRF1-5YLR467W 5391 nt8.29□□□□□ -1.08
YLL054CQ12244 YRF1-8YOR396W 5391 nt8.29□□□□□ -1.08
YLL054CQ12244 HSV2YGR223C 1347 nt8.29□□□□□ -1.08
YLL054CQ12244 ELO1YJL196C 933 nt8.28□□□□□ -1.08
YLL054CQ12244 GSF2YML048W 1212 nt8.28□□□□□ -1.08
YLL054CQ12244 ADH6YMR318C 1083 nt8.28□□□□□ -1.08
YLL054CQ12244 ORT1YOR130C 879 nt8.28□□□□□ -1.08
YLL054CQ12244 PRC1YMR297W 1599 nt8.27□□□□□ -1.09
YLL054CQ12244 CKI1YLR133W 1749 nt8.27□□□□□ -1.09
YLL054CQ12244 KEL3YPL263C 1956 nt8.27□□□□□ -1.09
YLL054CQ12244 ENO2YHR174W 1314 nt8.27□□□□□ -1.09
YLL054CQ12244 SMC5YOL034W 3282 nt8.26□□□□□ -1.09
YLL054CQ12244 KRR1YCL059C 951 nt8.26□□□□□ -1.09
YLL054CQ12244 PZF1YPR186C 1290 nt8.26□□□□□ -1.09
YLL054CQ12244 YDR306CYDR306C 1437 nt8.26□□□□□ -1.09
YLL054CQ12244 RPN14YGL004C 1254 nt8.25□□□□□ -1.09
YLL054CQ12244 YMR306C-AYMR306C-A 390 nt8.25□□□□□ -1.09
YLL054CQ12244 IDP3YNL009W 1263 nt8.25□□□□□ -1.09
YLL054CQ12244 YRF1-3YGR296W 5580 nt8.25□□□□□ -1.09
YLL054CQ12244 YRF1-6YNL339C 5580 nt8.25□□□□□ -1.09
YLL054CQ12244 YRF1-7YPL283C 5580 nt8.25□□□□□ -1.09
YLL054CQ12244 YMR265CYMR265C 1386 nt8.24□□□□□ -1.09
YLL054CQ12244 RMA1YKL132C 1293 nt8.24□□□□□ -1.09
YLL054CQ12244 AMF1YOR378W 1548 nt8.24□□□□□ -1.09
YLL054CQ12244 TUB4YLR212C 1422 nt8.23□□□□□ -1.09
YLL054CQ12244 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt8.23□□□□□ -1.09
YLL054CQ12244 HAP5YOR358W 729 nt8.23□□□□□ -1.09
YLL054CQ12244 snR31snR31 225 nt8.23□□□□□ -1.09
YLL054CQ12244 TRP2YER090W 1524 nt8.23□□□□□ -1.09
YLL054CQ12244 SIR2YDL042C 1689 nt8.22□□□□□ -1.09
YLL054CQ12244 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt8.22□□□□□ -1.09
YLL054CQ12244 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt8.22□□□□□ -1.09
YLL054CQ12244 PAU5YFL020C 369 nt8.22□□□□□ -1.09
YLL054CQ12244 YDR467CYDR467C 327 nt8.21□□□□□ -1.1
YLL054CQ12244 MPC1YGL080W 393 nt8.21□□□□□ -1.1
YLL054CQ12244 MRS3YJL133W 945 nt8.21□□□□□ -1.1
YLL054CQ12244 FCP1YMR277W 2199 nt8.2□□□□□ -1.1
YLL054CQ12244 SLM3YDL033C 1254 nt8.2□□□□□ -1.1
YLL054CQ12244 NDJ1YOL104C 1059 nt8.2□□□□□ -1.1
YLL054CQ12244 AI3Q0060 1248 nt8.19□□□□□ -1.1
YLL054CQ12244 ERG6YML008C 1152 nt8.19□□□□□ -1.1
YLL054CQ12244 YMR253CYMR253C 1245 nt8.19□□□□□ -1.1
YLL054CQ12244 KRE1YNL322C 942 nt8.19□□□□□ -1.1
YLL054CQ12244 YPL168WYPL168W 1293 nt8.19□□□□□ -1.1
YLL054CQ12244 ERR3YMR323W 1314 nt8.19□□□□□ -1.1
YLL054CQ12244 ERR1YOR393W 1314 nt8.19□□□□□ -1.1
YLL054CQ12244 ERR2YPL281C 1314 nt8.19□□□□□ -1.1
YLL054CQ12244 SUV3YPL029W 2214 nt8.18□□□□□ -1.1
YLL054CQ12244 HXT11YOL156W 1704 nt8.18□□□□□ -1.1
YLL054CQ12244 NIF3YGL221C 867 nt8.18□□□□□ -1.1
YLL054CQ12244 ESS1YJR017C 513 nt8.18□□□□□ -1.1
YLL054CQ12244 APS2YJR058C 444 nt8.18□□□□□ -1.1
YLL054CQ12244 STP3YLR375W 1032 nt8.18□□□□□ -1.1
YLL054CQ12244 YER152CYER152C 1332 nt8.18□□□□□ -1.1
YLL054CQ12244 ATG22YCL038C 1587 nt8.18□□□□□ -1.1
YLL054CQ12244 SWT21YNL187W 1074 nt8.17□□□□□ -1.1
YLL054CQ12244 TPC1YGR096W 945 nt8.16□□□□□ -1.1
YLL054CQ12244 TAF4YMR005W 1167 nt8.16□□□□□ -1.1
YLL054CQ12244 LEU2YCL018W 1095 nt8.16□□□□□ -1.1
YLL054CQ12244 PAR32YDL173W 888 nt8.15□□□□□ -1.1
YLL054CQ12244 SPE4YLR146C 903 nt8.15□□□□□ -1.1
YLL054CQ12244 YML079WYML079W 606 nt8.15□□□□□ -1.1
YLL054CQ12244 PGC1YPL206C 966 nt8.15□□□□□ -1.1
YLL054CQ12244 SRM1YGL097W 1449 nt8.14□□□□□ -1.11
YLL054CQ12244 YLR072WYLR072W 2082 nt8.14□□□□□ -1.11
YLL054CQ12244 CRC1YOR100C 984 nt8.14□□□□□ -1.11
YLL054CQ12244 YPR150WYPR150W 522 nt8.14□□□□□ -1.11
YLL054CQ12244 CRN1YLR429W 1956 nt8.13□□□□□ -1.11
YLL054CQ12244 AQR1YNL065W 1761 nt8.13□□□□□ -1.11
YLL054CQ12244 YNL234WYNL234W 1281 nt8.13□□□□□ -1.11
YLL054CQ12244 SPE2YOL052C 1191 nt8.13□□□□□ -1.11
YLL054CQ12244 PUS7YOR243C 2031 nt8.12□□□□□ -1.11
YLL054CQ12244 MMS21YEL019C 804 nt8.12□□□□□ -1.11
YLL054CQ12244 TOS2YGR221C 1869 nt8.11□□□□□ -1.11
YLL054CQ12244 MDH2YOL126C 1134 nt8.11□□□□□ -1.11
YLL054CQ12244 COA2YPL189C-A 207 nt8.11□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 83.8 ms