Protein–RNA interactions for Protein: Q12229

UBX3, UBX domain-containing protein 3, yeastyeast

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Length 455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBX3Q12229 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt7.95□□□□□ -1.14
UBX3Q12229 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt7.95□□□□□ -1.14
UBX3Q12229 YMR210WYMR210W 1350 nt7.95□□□□□ -1.14
UBX3Q12229 MIM1YOL026C 342 nt7.94□□□□□ -1.14
UBX3Q12229 LEA1YPL213W 717 nt7.94□□□□□ -1.14
UBX3Q12229 HBS1YKR084C 1836 nt7.94□□□□□ -1.14
UBX3Q12229 PDC6YGR087C 1692 nt7.93□□□□□ -1.14
UBX3Q12229 FRA1YLL029W 2250 nt7.93□□□□□ -1.14
UBX3Q12229 CHS7YHR142W 951 nt7.93□□□□□ -1.14
UBX3Q12229 YJR154WYJR154W 1041 nt7.93□□□□□ -1.14
UBX3Q12229 YMR166CYMR166C 1107 nt7.93□□□□□ -1.14
UBX3Q12229 YPL108WYPL108W 507 nt7.93□□□□□ -1.14
UBX3Q12229 SAM50YNL026W 1455 nt7.93□□□□□ -1.14
UBX3Q12229 YCP4YCR004C 744 nt7.92□□□□□ -1.14
UBX3Q12229 OCH1YGL038C 1443 nt7.92□□□□□ -1.14
UBX3Q12229 YRF1-3YGR296W 5580 nt7.91□□□□□ -1.14
UBX3Q12229 YRF1-6YNL339C 5580 nt7.91□□□□□ -1.14
UBX3Q12229 YRF1-7YPL283C 5580 nt7.91□□□□□ -1.14
UBX3Q12229 YOR072WYOR072W 315 nt7.91□□□□□ -1.14
UBX3Q12229 HIS3YOR202W 663 nt7.91□□□□□ -1.14
UBX3Q12229 ALD5YER073W 1563 nt7.91□□□□□ -1.14
UBX3Q12229 DUR3YHL016C 2208 nt7.91□□□□□ -1.14
UBX3Q12229 FTH1YBR207W 1398 nt7.9□□□□□ -1.14
UBX3Q12229 CAK1YFL029C 1107 nt7.9□□□□□ -1.14
UBX3Q12229 OLA1YBR025C 1185 nt7.89□□□□□ -1.15
UBX3Q12229 HXK1YFR053C 1458 nt7.88□□□□□ -1.15
UBX3Q12229 EHT1YBR177C 1356 nt7.88□□□□□ -1.15
UBX3Q12229 ORT1YOR130C 879 nt7.88□□□□□ -1.15
UBX3Q12229 LSP1YPL004C 1026 nt7.88□□□□□ -1.15
UBX3Q12229 LRO1YNR008W 1986 nt7.88□□□□□ -1.15
UBX3Q12229 FCY1YPR062W 477 nt7.86□□□□□ -1.15
UBX3Q12229 URA8YJR103W 1737 nt7.86□□□□□ -1.15
UBX3Q12229 DIP5YPL265W 1827 nt7.85□□□□□ -1.15
UBX3Q12229 BUD31YCR063W 474 nt7.85□□□□□ -1.15
UBX3Q12229 RRT14YIL127C 621 nt7.85□□□□□ -1.15
UBX3Q12229 PET18YCR020C 648 nt7.84□□□□□ -1.15
UBX3Q12229 YJL160CYJL160C 864 nt7.84□□□□□ -1.15
UBX3Q12229 SHC1YER096W 1539 nt7.83□□□□□ -1.16
UBX3Q12229 RHO1YPR165W 630 nt7.83□□□□□ -1.16
UBX3Q12229 MEX67YPL169C 1800 nt7.82□□□□□ -1.16
UBX3Q12229 INO1YJL153C 1602 nt7.82□□□□□ -1.16
UBX3Q12229 YGR139WYGR139W 339 nt7.82□□□□□ -1.16
UBX3Q12229 YMR007WYMR007W 381 nt7.82□□□□□ -1.16
UBX3Q12229 MRN1YPL184C 1839 nt7.81□□□□□ -1.16
UBX3Q12229 GLY1YEL046C 1164 nt7.81□□□□□ -1.16
UBX3Q12229 PUP3YER094C 618 nt7.81□□□□□ -1.16
UBX3Q12229 YIL177CYIL177C 5277 nt7.8□□□□□ -1.16
UBX3Q12229 NDE2YDL085W 1638 nt7.79□□□□□ -1.16
UBX3Q12229 snR4snR4 186 nt7.79□□□□□ -1.16
UBX3Q12229 TIF3YPR163C 1311 nt7.78□□□□□ -1.16
UBX3Q12229 HXT8YJL214W 1710 nt7.78□□□□□ -1.16
UBX3Q12229 YER156CYER156C 1017 nt7.78□□□□□ -1.16
UBX3Q12229 TDA4YJR116W 840 nt7.78□□□□□ -1.16
UBX3Q12229 BXI1YNL305C 894 nt7.78□□□□□ -1.16
UBX3Q12229 THI73YLR004C 1572 nt7.78□□□□□ -1.16
UBX3Q12229 WSC4YHL028W 1818 nt7.78□□□□□ -1.16
UBX3Q12229 TGL5YOR081C 2250 nt7.77□□□□□ -1.17
UBX3Q12229 RCF1YML030W 480 nt7.77□□□□□ -1.17
UBX3Q12229 ARO3YDR035W 1113 nt7.75□□□□□ -1.17
UBX3Q12229 INM1YHR046C 888 nt7.75□□□□□ -1.17
UBX3Q12229 YNL140CYNL140C 570 nt7.75□□□□□ -1.17
UBX3Q12229 RPS6AYPL090C 711 nt7.75□□□□□ -1.17
UBX3Q12229 RPS6BYBR181C 711 nt7.75□□□□□ -1.17
UBX3Q12229 DIA4YHR011W 1341 nt7.75□□□□□ -1.17
UBX3Q12229 ALG7YBR243C 1347 nt7.75□□□□□ -1.17
UBX3Q12229 WSC3YOL105C 1671 nt7.74□□□□□ -1.17
UBX3Q12229 YPT31YER031C 672 nt7.74□□□□□ -1.17
UBX3Q12229 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt7.73□□□□□ -1.17
UBX3Q12229 RCR1YBR005W 642 nt7.73□□□□□ -1.17
UBX3Q12229 TIM50YPL063W 1431 nt7.72□□□□□ -1.17
UBX3Q12229 DUS3YLR401C 2007 nt7.72□□□□□ -1.17
UBX3Q12229 ATP2YJR121W 1536 nt7.72□□□□□ -1.17
UBX3Q12229 UTR5YEL035C 501 nt7.71□□□□□ -1.18
UBX3Q12229 JHD1YER051W 1479 nt7.7□□□□□ -1.18
UBX3Q12229 YIA6YIL006W 1122 nt7.7□□□□□ -1.18
UBX3Q12229 MRP7YNL005C 1116 nt7.7□□□□□ -1.18
UBX3Q12229 PRE10YOR362C 867 nt7.69□□□□□ -1.18
UBX3Q12229 YLR173WYLR173W 1827 nt7.67□□□□□ -1.18
UBX3Q12229 NSG2YNL156C 900 nt7.67□□□□□ -1.18
UBX3Q12229 YPR084WYPR084W 1371 nt7.67□□□□□ -1.18
UBX3Q12229 ADE16YLR028C 1776 nt7.66□□□□□ -1.18
UBX3Q12229 YGR137WYGR137W 375 nt7.66□□□□□ -1.18
UBX3Q12229 MFT1YML062C 1179 nt7.66□□□□□ -1.18
UBX3Q12229 KTR4YBR199W 1395 nt7.66□□□□□ -1.18
UBX3Q12229 ADA2YDR448W 1305 nt7.65□□□□□ -1.18
UBX3Q12229 PMU1YKL128C 888 nt7.65□□□□□ -1.18
UBX3Q12229 YMR206WYMR206W 942 nt7.65□□□□□ -1.18
UBX3Q12229 ELP6YMR312W 822 nt7.65□□□□□ -1.18
UBX3Q12229 POP2YNR052C 1302 nt7.65□□□□□ -1.18
UBX3Q12229 MDL2YPL270W 2322 nt7.64□□□□□ -1.19
UBX3Q12229 SNP1YIL061C 903 nt7.64□□□□□ -1.19
UBX3Q12229 RIB1YBL033C 1038 nt7.63□□□□□ -1.19
UBX3Q12229 PMT1YDL095W 2454 nt7.62□□□□□ -1.19
UBX3Q12229 MET13YGL125W 1803 nt7.62□□□□□ -1.19
UBX3Q12229 ARG7YMR062C 1326 nt7.61□□□□□ -1.19
UBX3Q12229 RPL2AYFR031C-A 765 nt7.61□□□□□ -1.19
UBX3Q12229 SOD2YHR008C 702 nt7.61□□□□□ -1.19
UBX3Q12229 TPO1YLL028W 1761 nt7.61□□□□□ -1.19
UBX3Q12229 MTC6YHR151C 1581 nt7.6□□□□□ -1.19
UBX3Q12229 YIL168WYIL168W 384 nt7.6□□□□□ -1.19
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