Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5V9

Slc45a4, Solute carrier family 45 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc45a4Q0P5V9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc45a4Q0P5V9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc45a4Q0P5V9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc45a4Q0P5V9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc45a4Q0P5V9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc45a4Q0P5V9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc45a4Q0P5V9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc45a4Q0P5V9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc45a4Q0P5V9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc45a4Q0P5V9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc45a4Q0P5V9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc45a4Q0P5V9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc45a4Q0P5V9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc45a4Q0P5V9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc45a4Q0P5V9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc45a4Q0P5V9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc45a4Q0P5V9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc45a4Q0P5V9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc45a4Q0P5V9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc45a4Q0P5V9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc45a4Q0P5V9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc45a4Q0P5V9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc45a4Q0P5V9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc45a4Q0P5V9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc45a4Q0P5V9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc45a4Q0P5V9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc45a4Q0P5V9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc45a4Q0P5V9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Slc45a4Q0P5V9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
Slc45a4Q0P5V9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc45a4Q0P5V9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc45a4Q0P5V9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc45a4Q0P5V9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc45a4Q0P5V9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc45a4Q0P5V9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc45a4Q0P5V9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc45a4Q0P5V9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc45a4Q0P5V9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc45a4Q0P5V9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc45a4Q0P5V9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc45a4Q0P5V9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc45a4Q0P5V9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc45a4Q0P5V9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc45a4Q0P5V9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc45a4Q0P5V9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Slc45a4Q0P5V9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc45a4Q0P5V9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc45a4Q0P5V9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc45a4Q0P5V9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc45a4Q0P5V9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc45a4Q0P5V9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc45a4Q0P5V9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc45a4Q0P5V9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc45a4Q0P5V9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc45a4Q0P5V9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc45a4Q0P5V9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc45a4Q0P5V9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc45a4Q0P5V9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc45a4Q0P5V9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc45a4Q0P5V9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc45a4Q0P5V9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc45a4Q0P5V9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slc45a4Q0P5V9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slc45a4Q0P5V9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc45a4Q0P5V9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc45a4Q0P5V9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc45a4Q0P5V9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc45a4Q0P5V9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc45a4Q0P5V9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc45a4Q0P5V9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc45a4Q0P5V9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc45a4Q0P5V9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc45a4Q0P5V9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc45a4Q0P5V9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc45a4Q0P5V9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc45a4Q0P5V9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc45a4Q0P5V9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc45a4Q0P5V9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc45a4Q0P5V9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc45a4Q0P5V9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc45a4Q0P5V9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc45a4Q0P5V9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc45a4Q0P5V9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc45a4Q0P5V9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc45a4Q0P5V9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc45a4Q0P5V9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc45a4Q0P5V9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc45a4Q0P5V9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc45a4Q0P5V9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc45a4Q0P5V9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc45a4Q0P5V9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc45a4Q0P5V9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc45a4Q0P5V9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc45a4Q0P5V9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc45a4Q0P5V9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc45a4Q0P5V9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc45a4Q0P5V9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc45a4Q0P5V9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc45a4Q0P5V9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc45a4Q0P5V9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms