Protein–RNA interactions for Protein: Q04712

RRN11, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN11, yeastyeast

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Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRN11Q04712 PUS7YOR243C 2031 nt7.78□□□□□ -1.16
RRN11Q04712 YOR343CYOR343C 327 nt7.78□□□□□ -1.16
RRN11Q04712 LEU4YNL104C 1860 nt7.78□□□□□ -1.16
RRN11Q04712 YIL108WYIL108W 2091 nt7.78□□□□□ -1.16
RRN11Q04712 YFR020WYFR020W 699 nt7.77□□□□□ -1.17
RRN11Q04712 SBP1YHL034C 885 nt7.77□□□□□ -1.17
RRN11Q04712 GAS1YMR307W 1680 nt7.76□□□□□ -1.17
RRN11Q04712 RPL12BYDR418W 498 nt7.76□□□□□ -1.17
RRN11Q04712 SAN1YDR143C 1833 nt7.75□□□□□ -1.17
RRN11Q04712 YMR166CYMR166C 1107 nt7.75□□□□□ -1.17
RRN11Q04712 PAU21YOR394W 495 nt7.75□□□□□ -1.17
RRN11Q04712 PAU22YPL282C 495 nt7.75□□□□□ -1.17
RRN11Q04712 BAP3YDR046C 1815 nt7.75□□□□□ -1.17
RRN11Q04712 PTC6YCR079W 1329 nt7.75□□□□□ -1.17
RRN11Q04712 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt7.74□□□□□ -1.17
RRN11Q04712 EMC3YKL207W 762 nt7.74□□□□□ -1.17
RRN11Q04712 LSP1YPL004C 1026 nt7.74□□□□□ -1.17
RRN11Q04712 CKI1YLR133W 1749 nt7.74□□□□□ -1.17
RRN11Q04712 MSB3YNL293W 1902 nt7.73□□□□□ -1.17
RRN11Q04712 KGD2YDR148C 1392 nt7.72□□□□□ -1.17
RRN11Q04712 SMC5YOL034W 3282 nt7.72□□□□□ -1.17
RRN11Q04712 YDR467CYDR467C 327 nt7.72□□□□□ -1.17
RRN11Q04712 DUS3YLR401C 2007 nt7.72□□□□□ -1.17
RRN11Q04712 HEL1YKR017C 1656 nt7.72□□□□□ -1.17
RRN11Q04712 CHS7YHR142W 951 nt7.71□□□□□ -1.18
RRN11Q04712 YJL160CYJL160C 864 nt7.71□□□□□ -1.18
RRN11Q04712 MFT1YML062C 1179 nt7.71□□□□□ -1.18
RRN11Q04712 YMR210WYMR210W 1350 nt7.71□□□□□ -1.18
RRN11Q04712 NPP2YEL016C 1482 nt7.7□□□□□ -1.18
RRN11Q04712 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt7.7□□□□□ -1.18
RRN11Q04712 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt7.7□□□□□ -1.18
RRN11Q04712 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt7.7□□□□□ -1.18
RRN11Q04712 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt7.7□□□□□ -1.18
RRN11Q04712 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt7.7□□□□□ -1.18
RRN11Q04712 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt7.7□□□□□ -1.18
RRN11Q04712 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt7.7□□□□□ -1.18
RRN11Q04712 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt7.7□□□□□ -1.18
RRN11Q04712 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt7.7□□□□□ -1.18
RRN11Q04712 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt7.7□□□□□ -1.18
RRN11Q04712 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt7.7□□□□□ -1.18
RRN11Q04712 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt7.7□□□□□ -1.18
RRN11Q04712 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt7.7□□□□□ -1.18
RRN11Q04712 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt7.7□□□□□ -1.18
RRN11Q04712 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt7.7□□□□□ -1.18
RRN11Q04712 MRP1YDR347W 966 nt7.7□□□□□ -1.18
RRN11Q04712 OLA1YBR025C 1185 nt7.7□□□□□ -1.18
RRN11Q04712 HXT13YEL069C 1695 nt7.7□□□□□ -1.18
RRN11Q04712 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt7.69□□□□□ -1.18
RRN11Q04712 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt7.69□□□□□ -1.18
RRN11Q04712 YPR084WYPR084W 1371 nt7.69□□□□□ -1.18
RRN11Q04712 RRT14YIL127C 621 nt7.68□□□□□ -1.18
RRN11Q04712 YNL040WYNL040W 1371 nt7.68□□□□□ -1.18
RRN11Q04712 AFG2YLR397C 2343 nt7.68□□□□□ -1.18
RRN11Q04712 FET5YFL041W 1869 nt7.68□□□□□ -1.18
RRN11Q04712 YCR061WYCR061W 1896 nt7.67□□□□□ -1.18
RRN11Q04712 AIM34YMR003W 597 nt7.67□□□□□ -1.18
RRN11Q04712 ADH6YMR318C 1083 nt7.67□□□□□ -1.18
RRN11Q04712 HBS1YKR084C 1836 nt7.66□□□□□ -1.18
RRN11Q04712 TOP3YLR234W 1971 nt7.65□□□□□ -1.18
RRN11Q04712 YMR206WYMR206W 942 nt7.65□□□□□ -1.18
RRN11Q04712 GDH1YOR375C 1365 nt7.64□□□□□ -1.19
RRN11Q04712 CAK1YFL029C 1107 nt7.64□□□□□ -1.19
RRN11Q04712 GGA2YHR108W 1758 nt7.64□□□□□ -1.19
RRN11Q04712 CRN1YLR429W 1956 nt7.63□□□□□ -1.19
RRN11Q04712 YPT31YER031C 672 nt7.62□□□□□ -1.19
RRN11Q04712 GPM1YKL152C 744 nt7.62□□□□□ -1.19
RRN11Q04712 YBL095WYBL095W 813 nt7.62□□□□□ -1.19
RRN11Q04712 OCH1YGL038C 1443 nt7.61□□□□□ -1.19
RRN11Q04712 CHA1YCL064C 1083 nt7.61□□□□□ -1.19
RRN11Q04712 ATP10YLR393W 840 nt7.61□□□□□ -1.19
RRN11Q04712 YOR268CYOR268C 399 nt7.61□□□□□ -1.19
RRN11Q04712 YIR035CYIR035C 765 nt7.6□□□□□ -1.19
RRN11Q04712 TRP2YER090W 1524 nt7.59□□□□□ -1.19
RRN11Q04712 ADA2YDR448W 1305 nt7.58□□□□□ -1.2
RRN11Q04712 PET18YCR020C 648 nt7.58□□□□□ -1.2
RRN11Q04712 TAD2YJL035C 753 nt7.58□□□□□ -1.2
RRN11Q04712 Q0010Q0010 387 nt7.58□□□□□ -1.2
RRN11Q04712 YIL177CYIL177C 5277 nt7.58□□□□□ -1.2
RRN11Q04712 ADE16YLR028C 1776 nt7.58□□□□□ -1.2
RRN11Q04712 ATO2YNR002C 849 nt7.57□□□□□ -1.2
RRN11Q04712 HXT11YOL156W 1704 nt7.57□□□□□ -1.2
RRN11Q04712 MAS2YHR024C 1449 nt7.56□□□□□ -1.2
RRN11Q04712 MET22YOL064C 1074 nt7.56□□□□□ -1.2
RRN11Q04712 YMC2YBR104W 990 nt7.56□□□□□ -1.2
RRN11Q04712 AAT1YKL106W 1356 nt7.56□□□□□ -1.2
RRN11Q04712 YRF1-3YGR296W 5580 nt7.55□□□□□ -1.2
RRN11Q04712 YRF1-6YNL339C 5580 nt7.55□□□□□ -1.2
RRN11Q04712 YRF1-7YPL283C 5580 nt7.55□□□□□ -1.2
RRN11Q04712 YER156CYER156C 1017 nt7.55□□□□□ -1.2
RRN11Q04712 ORT1YOR130C 879 nt7.55□□□□□ -1.2
RRN11Q04712 ITR1YDR497C 1755 nt7.55□□□□□ -1.2
RRN11Q04712 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt7.54□□□□□ -1.2
RRN11Q04712 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt7.54□□□□□ -1.2
RRN11Q04712 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt7.54□□□□□ -1.2
RRN11Q04712 SUP51tL(UAA)J 84 nt7.54□□□□□ -1.2
RRN11Q04712 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt7.54□□□□□ -1.2
RRN11Q04712 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt7.54□□□□□ -1.2
RRN11Q04712 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt7.54□□□□□ -1.2
RRN11Q04712 YJL009WYJL009W 327 nt7.54□□□□□ -1.2
RRN11Q04712 RPS6AYPL090C 711 nt7.54□□□□□ -1.2
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