Protein–RNA interactions for Protein: Q03954

SPC19, DASH complex subunit SPC19, yeastyeast

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPC19Q03954 YLR349WYLR349W 507 nt7.5□□□□□ -1.21
SPC19Q03954 FSH2YMR222C 672 nt7.5□□□□□ -1.21
SPC19Q03954 CKI1YLR133W 1749 nt7.49□□□□□ -1.21
SPC19Q03954 YIP4YGL198W 708 nt7.49□□□□□ -1.21
SPC19Q03954 NIF3YGL221C 867 nt7.49□□□□□ -1.21
SPC19Q03954 YJL009WYJL009W 327 nt7.49□□□□□ -1.21
SPC19Q03954 GDA1YEL042W 1557 nt7.48□□□□□ -1.21
SPC19Q03954 RRP46YGR095C 672 nt7.48□□□□□ -1.21
SPC19Q03954 THP3YPR045C 1413 nt7.48□□□□□ -1.21
SPC19Q03954 BAP3YDR046C 1815 nt7.48□□□□□ -1.21
SPC19Q03954 PAU15YIR041W 375 nt7.47□□□□□ -1.21
SPC19Q03954 ESS1YJR017C 513 nt7.47□□□□□ -1.21
SPC19Q03954 RSM7YJR113C 744 nt7.47□□□□□ -1.21
SPC19Q03954 YOS9YDR057W 1629 nt7.47□□□□□ -1.21
SPC19Q03954 FET5YFL041W 1869 nt7.47□□□□□ -1.21
SPC19Q03954 ASN2YGR124W 1719 nt7.46□□□□□ -1.22
SPC19Q03954 LPD1YFL018C 1500 nt7.46□□□□□ -1.22
SPC19Q03954 CDC16YKL022C 2523 nt7.45□□□□□ -1.22
SPC19Q03954 SNU71YGR013W 1863 nt7.45□□□□□ -1.22
SPC19Q03954 PAU5YFL020C 369 nt7.45□□□□□ -1.22
SPC19Q03954 RMA1YKL132C 1293 nt7.45□□□□□ -1.22
SPC19Q03954 ORT1YOR130C 879 nt7.45□□□□□ -1.22
SPC19Q03954 LYS20YDL182W 1287 nt7.44□□□□□ -1.22
SPC19Q03954 TMS1YDR105C 1422 nt7.44□□□□□ -1.22
SPC19Q03954 HBS1YKR084C 1836 nt7.43□□□□□ -1.22
SPC19Q03954 PAR32YDL173W 888 nt7.43□□□□□ -1.22
SPC19Q03954 YTH1YPR107C 627 nt7.43□□□□□ -1.22
SPC19Q03954 POX1YGL205W 2247 nt7.43□□□□□ -1.22
SPC19Q03954 HXT11YOL156W 1704 nt7.42□□□□□ -1.22
SPC19Q03954 snR86snR86 1004 nt7.42□□□□□ -1.22
SPC19Q03954 FZF1YGL254W 900 nt7.42□□□□□ -1.22
SPC19Q03954 NDE1YMR145C 1683 nt7.41□□□□□ -1.22
SPC19Q03954 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt7.41□□□□□ -1.22
SPC19Q03954 NAS2YIL007C 663 nt7.41□□□□□ -1.22
SPC19Q03954 ENO1YGR254W 1314 nt7.41□□□□□ -1.22
SPC19Q03954 RGT2YDL138W 2292 nt7.41□□□□□ -1.22
SPC19Q03954 BUD9YGR041W 1644 nt7.41□□□□□ -1.22
SPC19Q03954 MOB1YIL106W 945 nt7.4□□□□□ -1.22
SPC19Q03954 YIR035CYIR035C 765 nt7.4□□□□□ -1.22
SPC19Q03954 YJR149WYJR149W 1215 nt7.4□□□□□ -1.22
SPC19Q03954 YMR210WYMR210W 1350 nt7.4□□□□□ -1.22
SPC19Q03954 SDS24YBR214W 1584 nt7.4□□□□□ -1.22
SPC19Q03954 STP3YLR375W 1032 nt7.39□□□□□ -1.23
SPC19Q03954 IGD1YFR017C 588 nt7.38□□□□□ -1.23
SPC19Q03954 UFD1YGR048W 1086 nt7.37□□□□□ -1.23
SPC19Q03954 YLR460CYLR460C 1131 nt7.37□□□□□ -1.23
SPC19Q03954 BUB2YMR055C 921 nt7.37□□□□□ -1.23
SPC19Q03954 ADH3YMR083W 1128 nt7.37□□□□□ -1.23
SPC19Q03954 snR4snR4 186 nt7.36□□□□□ -1.23
SPC19Q03954 SRM1YGL097W 1449 nt7.35□□□□□ -1.23
SPC19Q03954 VBA3YCL069W 1377 nt7.34□□□□□ -1.23
SPC19Q03954 LEA1YPL213W 717 nt7.34□□□□□ -1.23
SPC19Q03954 SPS22YCL048W 1392 nt7.33□□□□□ -1.24
SPC19Q03954 PHB2YGR231C 933 nt7.33□□□□□ -1.24
SPC19Q03954 HIS3YOR202W 663 nt7.33□□□□□ -1.24
SPC19Q03954 PGC1YPL206C 966 nt7.33□□□□□ -1.24
SPC19Q03954 BEM1YBR200W 1656 nt7.32□□□□□ -1.24
SPC19Q03954 RAD51YER095W 1203 nt7.32□□□□□ -1.24
SPC19Q03954 ADE16YLR028C 1776 nt7.32□□□□□ -1.24
SPC19Q03954 CCR4YAL021C 2514 nt7.32□□□□□ -1.24
SPC19Q03954 NDE2YDL085W 1638 nt7.31□□□□□ -1.24
SPC19Q03954 YRF1-1YDR545W 5391 nt7.31□□□□□ -1.24
SPC19Q03954 YRF1-5YLR467W 5391 nt7.31□□□□□ -1.24
SPC19Q03954 YRF1-8YOR396W 5391 nt7.31□□□□□ -1.24
SPC19Q03954 FIT1YDR534C 1587 nt7.31□□□□□ -1.24
SPC19Q03954 PUS5YLR165C 765 nt7.31□□□□□ -1.24
SPC19Q03954 CHS7YHR142W 951 nt7.3□□□□□ -1.24
SPC19Q03954 FLX1YIL134W 936 nt7.3□□□□□ -1.24
SPC19Q03954 CYC3YAL039C 810 nt7.3□□□□□ -1.24
SPC19Q03954 OLA1YBR025C 1185 nt7.3□□□□□ -1.24
SPC19Q03954 FTH1YBR207W 1398 nt7.3□□□□□ -1.24
SPC19Q03954 MEP1YGR121C 1479 nt7.3□□□□□ -1.24
SPC19Q03954 YBR056WYBR056W 1506 nt7.29□□□□□ -1.24
SPC19Q03954 YFR020WYFR020W 699 nt7.29□□□□□ -1.24
SPC19Q03954 CDD1YLR245C 429 nt7.29□□□□□ -1.24
SPC19Q03954 MPA43YNL249C 1629 nt7.29□□□□□ -1.24
SPC19Q03954 NSE5YML023C 1671 nt7.28□□□□□ -1.24
SPC19Q03954 YLR280CYLR280C 351 nt7.28□□□□□ -1.24
SPC19Q03954 ADH6YMR318C 1083 nt7.28□□□□□ -1.24
SPC19Q03954 YCR061WYCR061W 1896 nt7.28□□□□□ -1.24
SPC19Q03954 POP2YNR052C 1302 nt7.27□□□□□ -1.24
SPC19Q03954 MAS2YHR024C 1449 nt7.27□□□□□ -1.24
SPC19Q03954 INO1YJL153C 1602 nt7.27□□□□□ -1.25
SPC19Q03954 YNL140CYNL140C 570 nt7.27□□□□□ -1.25
SPC19Q03954 YFL052WYFL052W 1398 nt7.27□□□□□ -1.25
SPC19Q03954 ELP3YPL086C 1674 nt7.27□□□□□ -1.25
SPC19Q03954 YLR072WYLR072W 2082 nt7.27□□□□□ -1.25
SPC19Q03954 DIA4YHR011W 1341 nt7.27□□□□□ -1.25
SPC19Q03954 FET4YMR319C 1659 nt7.26□□□□□ -1.25
SPC19Q03954 YCR025CYCR025C 411 nt7.26□□□□□ -1.25
SPC19Q03954 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt7.26□□□□□ -1.25
SPC19Q03954 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt7.26□□□□□ -1.25
SPC19Q03954 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt7.26□□□□□ -1.25
SPC19Q03954 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt7.26□□□□□ -1.25
SPC19Q03954 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt7.26□□□□□ -1.25
SPC19Q03954 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt7.26□□□□□ -1.25
SPC19Q03954 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt7.26□□□□□ -1.25
SPC19Q03954 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt7.26□□□□□ -1.25
SPC19Q03954 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt7.26□□□□□ -1.25
SPC19Q03954 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 36.1 ms