Protein–RNA interactions for Protein: Q03721

KCNC4, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC4Q03721 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNC4Q03721 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNC4Q03721 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNC4Q03721 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNC4Q03721 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNC4Q03721 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNC4Q03721 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNC4Q03721 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNC4Q03721 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNC4Q03721 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNC4Q03721 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNC4Q03721 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNC4Q03721 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNC4Q03721 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNC4Q03721 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNC4Q03721 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNC4Q03721 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNC4Q03721 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNC4Q03721 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNC4Q03721 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNC4Q03721 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNC4Q03721 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNC4Q03721 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNC4Q03721 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNC4Q03721 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNC4Q03721 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNC4Q03721 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNC4Q03721 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNC4Q03721 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNC4Q03721 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNC4Q03721 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNC4Q03721 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KCNC4Q03721 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNC4Q03721 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNC4Q03721 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNC4Q03721 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNC4Q03721 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNC4Q03721 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNC4Q03721 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNC4Q03721 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNC4Q03721 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNC4Q03721 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNC4Q03721 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNC4Q03721 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNC4Q03721 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNC4Q03721 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNC4Q03721 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNC4Q03721 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNC4Q03721 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNC4Q03721 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNC4Q03721 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNC4Q03721 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNC4Q03721 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNC4Q03721 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KCNC4Q03721 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KCNC4Q03721 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KCNC4Q03721 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNC4Q03721 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNC4Q03721 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNC4Q03721 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNC4Q03721 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNC4Q03721 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNC4Q03721 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNC4Q03721 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNC4Q03721 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNC4Q03721 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNC4Q03721 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNC4Q03721 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNC4Q03721 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNC4Q03721 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNC4Q03721 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNC4Q03721 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNC4Q03721 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNC4Q03721 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNC4Q03721 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNC4Q03721 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNC4Q03721 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNC4Q03721 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNC4Q03721 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNC4Q03721 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNC4Q03721 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNC4Q03721 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNC4Q03721 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNC4Q03721 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNC4Q03721 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNC4Q03721 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNC4Q03721 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNC4Q03721 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNC4Q03721 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNC4Q03721 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNC4Q03721 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KCNC4Q03721 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KCNC4Q03721 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNC4Q03721 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNC4Q03721 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNC4Q03721 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNC4Q03721 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNC4Q03721 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNC4Q03721 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNC4Q03721 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms