Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPEQ02224 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPEQ02224 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPEQ02224 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPEQ02224 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPEQ02224 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPEQ02224 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPEQ02224 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPEQ02224 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPEQ02224 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPEQ02224 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPEQ02224 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPEQ02224 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPEQ02224 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPEQ02224 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPEQ02224 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPEQ02224 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPEQ02224 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPEQ02224 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPEQ02224 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPEQ02224 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPEQ02224 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPEQ02224 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPEQ02224 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPEQ02224 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPEQ02224 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPEQ02224 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPEQ02224 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPEQ02224 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPEQ02224 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPEQ02224 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPEQ02224 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPEQ02224 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPEQ02224 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPEQ02224 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPEQ02224 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPEQ02224 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPEQ02224 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPEQ02224 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPEQ02224 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPEQ02224 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPEQ02224 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPEQ02224 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPEQ02224 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPEQ02224 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPEQ02224 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CENPEQ02224 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPEQ02224 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPEQ02224 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPEQ02224 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPEQ02224 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPEQ02224 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPEQ02224 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPEQ02224 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPEQ02224 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPEQ02224 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPEQ02224 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPEQ02224 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPEQ02224 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPEQ02224 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPEQ02224 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPEQ02224 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPEQ02224 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPEQ02224 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPEQ02224 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPEQ02224 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPEQ02224 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPEQ02224 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPEQ02224 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPEQ02224 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPEQ02224 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPEQ02224 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPEQ02224 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CENPEQ02224 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPEQ02224 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPEQ02224 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPEQ02224 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPEQ02224 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPEQ02224 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPEQ02224 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPEQ02224 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPEQ02224 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPEQ02224 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPEQ02224 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPEQ02224 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPEQ02224 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPEQ02224 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPEQ02224 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPEQ02224 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPEQ02224 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPEQ02224 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPEQ02224 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPEQ02224 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPEQ02224 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPEQ02224 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPEQ02224 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPEQ02224 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CENPEQ02224 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CENPEQ02224 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPEQ02224 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms