Protein–RNA interactions for Protein: P62820

RAB1A, Ras-related protein Rab-1A, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1AP62820 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB1AP62820 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB1AP62820 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB1AP62820 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB1AP62820 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB1AP62820 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB1AP62820 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB1AP62820 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB1AP62820 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB1AP62820 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB1AP62820 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB1AP62820 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB1AP62820 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB1AP62820 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB1AP62820 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB1AP62820 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB1AP62820 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB1AP62820 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB1AP62820 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB1AP62820 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB1AP62820 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB1AP62820 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB1AP62820 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB1AP62820 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB1AP62820 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB1AP62820 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB1AP62820 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB1AP62820 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB1AP62820 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB1AP62820 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB1AP62820 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB1AP62820 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB1AP62820 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB1AP62820 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB1AP62820 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB1AP62820 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB1AP62820 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB1AP62820 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB1AP62820 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB1AP62820 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB1AP62820 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB1AP62820 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB1AP62820 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB1AP62820 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB1AP62820 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB1AP62820 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB1AP62820 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB1AP62820 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB1AP62820 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB1AP62820 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB1AP62820 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB1AP62820 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB1AP62820 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB1AP62820 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB1AP62820 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB1AP62820 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB1AP62820 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB1AP62820 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB1AP62820 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB1AP62820 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB1AP62820 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB1AP62820 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB1AP62820 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB1AP62820 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB1AP62820 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB1AP62820 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB1AP62820 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB1AP62820 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB1AP62820 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB1AP62820 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB1AP62820 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB1AP62820 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB1AP62820 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB1AP62820 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB1AP62820 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB1AP62820 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB1AP62820 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB1AP62820 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB1AP62820 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB1AP62820 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB1AP62820 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB1AP62820 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB1AP62820 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB1AP62820 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB1AP62820 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB1AP62820 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB1AP62820 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB1AP62820 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB1AP62820 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB1AP62820 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB1AP62820 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB1AP62820 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB1AP62820 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB1AP62820 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB1AP62820 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB1AP62820 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB1AP62820 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB1AP62820 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB1AP62820 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB1AP62820 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms