Protein–RNA interactions for Protein: P57768

SNX16, Sorting nexin-16, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX16P57768 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
SNX16P57768 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SNX16P57768 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SNX16P57768 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SNX16P57768 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SNX16P57768 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SNX16P57768 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SNX16P57768 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SNX16P57768 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SNX16P57768 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SNX16P57768 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SNX16P57768 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNX16P57768 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNX16P57768 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNX16P57768 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNX16P57768 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNX16P57768 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNX16P57768 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SNX16P57768 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SNX16P57768 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SNX16P57768 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SNX16P57768 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SNX16P57768 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SNX16P57768 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SNX16P57768 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SNX16P57768 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SNX16P57768 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNX16P57768 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNX16P57768 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNX16P57768 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNX16P57768 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNX16P57768 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNX16P57768 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNX16P57768 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SNX16P57768 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SNX16P57768 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SNX16P57768 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SNX16P57768 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SNX16P57768 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SNX16P57768 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SNX16P57768 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SNX16P57768 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SNX16P57768 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SNX16P57768 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SNX16P57768 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNX16P57768 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNX16P57768 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNX16P57768 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNX16P57768 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNX16P57768 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNX16P57768 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNX16P57768 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNX16P57768 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SNX16P57768 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SNX16P57768 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SNX16P57768 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SNX16P57768 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SNX16P57768 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SNX16P57768 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SNX16P57768 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SNX16P57768 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SNX16P57768 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SNX16P57768 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SNX16P57768 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SNX16P57768 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SNX16P57768 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SNX16P57768 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SNX16P57768 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SNX16P57768 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNX16P57768 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNX16P57768 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNX16P57768 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNX16P57768 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNX16P57768 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNX16P57768 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNX16P57768 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SNX16P57768 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SNX16P57768 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SNX16P57768 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SNX16P57768 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SNX16P57768 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SNX16P57768 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SNX16P57768 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SNX16P57768 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SNX16P57768 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNX16P57768 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNX16P57768 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SNX16P57768 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNX16P57768 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNX16P57768 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNX16P57768 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNX16P57768 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNX16P57768 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNX16P57768 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNX16P57768 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNX16P57768 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNX16P57768 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNX16P57768 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNX16P57768 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNX16P57768 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms