Protein–RNA interactions for Protein: P54252

ATXN3, Ataxin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3P54252 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ATXN3P54252 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATXN3P54252 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATXN3P54252 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATXN3P54252 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATXN3P54252 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATXN3P54252 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATXN3P54252 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATXN3P54252 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATXN3P54252 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATXN3P54252 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ATXN3P54252 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATXN3P54252 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATXN3P54252 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATXN3P54252 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATXN3P54252 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATXN3P54252 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATXN3P54252 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATXN3P54252 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ATXN3P54252 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATXN3P54252 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATXN3P54252 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATXN3P54252 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATXN3P54252 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATXN3P54252 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATXN3P54252 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATXN3P54252 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATXN3P54252 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATXN3P54252 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATXN3P54252 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATXN3P54252 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATXN3P54252 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATXN3P54252 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATXN3P54252 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATXN3P54252 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ATXN3P54252 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATXN3P54252 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATXN3P54252 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATXN3P54252 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATXN3P54252 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATXN3P54252 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ATXN3P54252 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATXN3P54252 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATXN3P54252 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATXN3P54252 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATXN3P54252 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATXN3P54252 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATXN3P54252 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATXN3P54252 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATXN3P54252 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATXN3P54252 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATXN3P54252 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATXN3P54252 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATXN3P54252 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATXN3P54252 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATXN3P54252 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ATXN3P54252 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ATXN3P54252 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATXN3P54252 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATXN3P54252 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATXN3P54252 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATXN3P54252 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATXN3P54252 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATXN3P54252 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATXN3P54252 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATXN3P54252 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATXN3P54252 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATXN3P54252 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATXN3P54252 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATXN3P54252 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATXN3P54252 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATXN3P54252 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATXN3P54252 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATXN3P54252 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATXN3P54252 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATXN3P54252 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATXN3P54252 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATXN3P54252 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATXN3P54252 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATXN3P54252 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATXN3P54252 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATXN3P54252 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATXN3P54252 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATXN3P54252 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATXN3P54252 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATXN3P54252 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATXN3P54252 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATXN3P54252 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATXN3P54252 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATXN3P54252 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATXN3P54252 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATXN3P54252 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATXN3P54252 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATXN3P54252 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATXN3P54252 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATXN3P54252 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATXN3P54252 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATXN3P54252 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATXN3P54252 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATXN3P54252 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms