Protein–RNA interactions for Protein: P53384

NUBP1, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP1, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBP1P53384 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUBP1P53384 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUBP1P53384 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NUBP1P53384 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUBP1P53384 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUBP1P53384 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUBP1P53384 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUBP1P53384 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUBP1P53384 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
NUBP1P53384 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUBP1P53384 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NUBP1P53384 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NUBP1P53384 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NUBP1P53384 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NUBP1P53384 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NUBP1P53384 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NUBP1P53384 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUBP1P53384 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUBP1P53384 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUBP1P53384 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUBP1P53384 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUBP1P53384 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUBP1P53384 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NUBP1P53384 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NUBP1P53384 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NUBP1P53384 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NUBP1P53384 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NUBP1P53384 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NUBP1P53384 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUBP1P53384 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUBP1P53384 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUBP1P53384 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUBP1P53384 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NUBP1P53384 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NUBP1P53384 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUBP1P53384 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NUBP1P53384 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUBP1P53384 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NUBP1P53384 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUBP1P53384 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUBP1P53384 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUBP1P53384 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUBP1P53384 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUBP1P53384 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUBP1P53384 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUBP1P53384 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUBP1P53384 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUBP1P53384 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NUBP1P53384 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NUBP1P53384 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUBP1P53384 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUBP1P53384 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUBP1P53384 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUBP1P53384 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUBP1P53384 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUBP1P53384 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUBP1P53384 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUBP1P53384 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUBP1P53384 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUBP1P53384 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NUBP1P53384 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
NUBP1P53384 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NUBP1P53384 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NUBP1P53384 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NUBP1P53384 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUBP1P53384 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUBP1P53384 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUBP1P53384 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUBP1P53384 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUBP1P53384 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUBP1P53384 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NUBP1P53384 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUBP1P53384 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NUBP1P53384 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NUBP1P53384 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUBP1P53384 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUBP1P53384 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUBP1P53384 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUBP1P53384 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUBP1P53384 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUBP1P53384 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUBP1P53384 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NUBP1P53384 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NUBP1P53384 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NUBP1P53384 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NUBP1P53384 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NUBP1P53384 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NUBP1P53384 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
NUBP1P53384 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NUBP1P53384 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NUBP1P53384 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NUBP1P53384 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NUBP1P53384 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NUBP1P53384 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NUBP1P53384 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NUBP1P53384 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NUBP1P53384 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUBP1P53384 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUBP1P53384 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUBP1P53384 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 814.7 ms