Protein–RNA interactions for Protein: P38117

ETFB, Electron transfer flavoprotein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFBP38117 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ETFBP38117 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ETFBP38117 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ETFBP38117 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ETFBP38117 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ETFBP38117 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ETFBP38117 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ETFBP38117 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ETFBP38117 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ETFBP38117 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ETFBP38117 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ETFBP38117 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ETFBP38117 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ETFBP38117 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ETFBP38117 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ETFBP38117 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ETFBP38117 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ETFBP38117 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ETFBP38117 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
ETFBP38117 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ETFBP38117 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ETFBP38117 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ETFBP38117 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ETFBP38117 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ETFBP38117 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ETFBP38117 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ETFBP38117 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ETFBP38117 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ETFBP38117 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ETFBP38117 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ETFBP38117 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ETFBP38117 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ETFBP38117 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ETFBP38117 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ETFBP38117 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
ETFBP38117 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
ETFBP38117 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
ETFBP38117 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
ETFBP38117 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
ETFBP38117 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
ETFBP38117 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
ETFBP38117 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
ETFBP38117 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
ETFBP38117 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ETFBP38117 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ETFBP38117 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ETFBP38117 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ETFBP38117 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ETFBP38117 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ETFBP38117 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ETFBP38117 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ETFBP38117 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ETFBP38117 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ETFBP38117 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ETFBP38117 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ETFBP38117 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ETFBP38117 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ETFBP38117 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ETFBP38117 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ETFBP38117 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ETFBP38117 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ETFBP38117 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ETFBP38117 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ETFBP38117 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ETFBP38117 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ETFBP38117 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ETFBP38117 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ETFBP38117 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ETFBP38117 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ETFBP38117 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ETFBP38117 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ETFBP38117 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ETFBP38117 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ETFBP38117 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ETFBP38117 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ETFBP38117 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ETFBP38117 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ETFBP38117 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ETFBP38117 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ETFBP38117 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ETFBP38117 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ETFBP38117 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ETFBP38117 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ETFBP38117 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ETFBP38117 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ETFBP38117 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ETFBP38117 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ETFBP38117 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ETFBP38117 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ETFBP38117 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ETFBP38117 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ETFBP38117 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ETFBP38117 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ETFBP38117 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ETFBP38117 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ETFBP38117 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ETFBP38117 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ETFBP38117 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ETFBP38117 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ETFBP38117 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms