Protein–RNA interactions for Protein: P27658

COL8A1, Collagen alpha-1(VIII) chain, humanhuman

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL8A1P27658 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL8A1P27658 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL8A1P27658 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL8A1P27658 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL8A1P27658 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL8A1P27658 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL8A1P27658 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL8A1P27658 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL8A1P27658 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL8A1P27658 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
COL8A1P27658 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL8A1P27658 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL8A1P27658 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
COL8A1P27658 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL8A1P27658 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL8A1P27658 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL8A1P27658 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL8A1P27658 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL8A1P27658 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL8A1P27658 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
COL8A1P27658 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL8A1P27658 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL8A1P27658 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL8A1P27658 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL8A1P27658 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL8A1P27658 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL8A1P27658 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL8A1P27658 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL8A1P27658 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL8A1P27658 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL8A1P27658 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL8A1P27658 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL8A1P27658 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL8A1P27658 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL8A1P27658 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
COL8A1P27658 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
COL8A1P27658 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL8A1P27658 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL8A1P27658 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL8A1P27658 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL8A1P27658 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL8A1P27658 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL8A1P27658 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL8A1P27658 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL8A1P27658 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL8A1P27658 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL8A1P27658 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL8A1P27658 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL8A1P27658 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL8A1P27658 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL8A1P27658 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL8A1P27658 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL8A1P27658 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
COL8A1P27658 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL8A1P27658 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL8A1P27658 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL8A1P27658 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL8A1P27658 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL8A1P27658 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL8A1P27658 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
COL8A1P27658 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
COL8A1P27658 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL8A1P27658 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL8A1P27658 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL8A1P27658 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
COL8A1P27658 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL8A1P27658 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL8A1P27658 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL8A1P27658 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL8A1P27658 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL8A1P27658 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL8A1P27658 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
COL8A1P27658 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL8A1P27658 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL8A1P27658 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL8A1P27658 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL8A1P27658 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL8A1P27658 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL8A1P27658 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL8A1P27658 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL8A1P27658 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL8A1P27658 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL8A1P27658 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL8A1P27658 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL8A1P27658 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL8A1P27658 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL8A1P27658 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL8A1P27658 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL8A1P27658 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL8A1P27658 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
COL8A1P27658 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL8A1P27658 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL8A1P27658 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL8A1P27658 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
COL8A1P27658 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL8A1P27658 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL8A1P27658 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
COL8A1P27658 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL8A1P27658 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL8A1P27658 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms