Protein–RNA interactions for Protein: P24046

GABRR1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-1, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR1P24046 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABRR1P24046 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABRR1P24046 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABRR1P24046 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABRR1P24046 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABRR1P24046 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABRR1P24046 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABRR1P24046 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABRR1P24046 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GABRR1P24046 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GABRR1P24046 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GABRR1P24046 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GABRR1P24046 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GABRR1P24046 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GABRR1P24046 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GABRR1P24046 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GABRR1P24046 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GABRR1P24046 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GABRR1P24046 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABRR1P24046 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABRR1P24046 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABRR1P24046 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABRR1P24046 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GABRR1P24046 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GABRR1P24046 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GABRR1P24046 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GABRR1P24046 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GABRR1P24046 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABRR1P24046 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABRR1P24046 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABRR1P24046 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABRR1P24046 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABRR1P24046 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABRR1P24046 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABRR1P24046 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABRR1P24046 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABRR1P24046 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABRR1P24046 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABRR1P24046 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABRR1P24046 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABRR1P24046 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GABRR1P24046 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GABRR1P24046 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GABRR1P24046 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GABRR1P24046 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABRR1P24046 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABRR1P24046 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABRR1P24046 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABRR1P24046 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABRR1P24046 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GABRR1P24046 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABRR1P24046 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABRR1P24046 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABRR1P24046 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABRR1P24046 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABRR1P24046 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABRR1P24046 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABRR1P24046 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABRR1P24046 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABRR1P24046 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GABRR1P24046 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABRR1P24046 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABRR1P24046 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABRR1P24046 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABRR1P24046 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABRR1P24046 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABRR1P24046 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GABRR1P24046 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABRR1P24046 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABRR1P24046 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABRR1P24046 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABRR1P24046 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABRR1P24046 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABRR1P24046 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABRR1P24046 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABRR1P24046 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABRR1P24046 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABRR1P24046 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GABRR1P24046 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GABRR1P24046 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABRR1P24046 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABRR1P24046 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABRR1P24046 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABRR1P24046 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABRR1P24046 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABRR1P24046 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABRR1P24046 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABRR1P24046 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABRR1P24046 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GABRR1P24046 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABRR1P24046 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABRR1P24046 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABRR1P24046 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABRR1P24046 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABRR1P24046 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABRR1P24046 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABRR1P24046 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABRR1P24046 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABRR1P24046 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GABRR1P24046 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms