Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPREP23469 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTPREP23469 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PTPREP23469 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PTPREP23469 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PTPREP23469 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PTPREP23469 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPREP23469 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPREP23469 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPREP23469 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPREP23469 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPREP23469 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTPREP23469 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTPREP23469 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPREP23469 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTPREP23469 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTPREP23469 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTPREP23469 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
PTPREP23469 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTPREP23469 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTPREP23469 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTPREP23469 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTPREP23469 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTPREP23469 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTPREP23469 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTPREP23469 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTPREP23469 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPREP23469 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPREP23469 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPREP23469 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPREP23469 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPREP23469 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPREP23469 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPREP23469 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPREP23469 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPREP23469 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPREP23469 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPREP23469 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPREP23469 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPREP23469 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTPREP23469 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTPREP23469 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTPREP23469 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTPREP23469 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTPREP23469 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTPREP23469 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTPREP23469 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTPREP23469 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTPREP23469 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTPREP23469 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPREP23469 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPREP23469 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPREP23469 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTPREP23469 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTPREP23469 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTPREP23469 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTPREP23469 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTPREP23469 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PTPREP23469 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPREP23469 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPREP23469 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPREP23469 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPREP23469 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPREP23469 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPREP23469 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTPREP23469 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTPREP23469 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PTPREP23469 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPREP23469 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PTPREP23469 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PTPREP23469 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PTPREP23469 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPREP23469 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPREP23469 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPREP23469 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPREP23469 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTPREP23469 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTPREP23469 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTPREP23469 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTPREP23469 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTPREP23469 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTPREP23469 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTPREP23469 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTPREP23469 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTPREP23469 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPREP23469 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPREP23469 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPREP23469 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPREP23469 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPREP23469 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPREP23469 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
PTPREP23469 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPREP23469 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPREP23469 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTPREP23469 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTPREP23469 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTPREP23469 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPREP23469 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPREP23469 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPREP23469 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.6 ms