Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EPHA1P21709 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EPHA1P21709 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
EPHA1P21709 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
EPHA1P21709 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
EPHA1P21709 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EPHA1P21709 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EPHA1P21709 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EPHA1P21709 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EPHA1P21709 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EPHA1P21709 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EPHA1P21709 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EPHA1P21709 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EPHA1P21709 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
EPHA1P21709 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EPHA1P21709 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EPHA1P21709 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EPHA1P21709 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
EPHA1P21709 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EPHA1P21709 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EPHA1P21709 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EPHA1P21709 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EPHA1P21709 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EPHA1P21709 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
EPHA1P21709 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
EPHA1P21709 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
EPHA1P21709 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EPHA1P21709 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EPHA1P21709 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EPHA1P21709 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EPHA1P21709 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EPHA1P21709 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EPHA1P21709 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EPHA1P21709 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EPHA1P21709 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EPHA1P21709 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EPHA1P21709 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EPHA1P21709 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EPHA1P21709 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EPHA1P21709 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EPHA1P21709 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EPHA1P21709 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EPHA1P21709 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EPHA1P21709 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EPHA1P21709 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EPHA1P21709 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EPHA1P21709 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EPHA1P21709 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EPHA1P21709 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EPHA1P21709 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EPHA1P21709 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
EPHA1P21709 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EPHA1P21709 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EPHA1P21709 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EPHA1P21709 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EPHA1P21709 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EPHA1P21709 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EPHA1P21709 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
EPHA1P21709 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPHA1P21709 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPHA1P21709 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPHA1P21709 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPHA1P21709 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPHA1P21709 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EPHA1P21709 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EPHA1P21709 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EPHA1P21709 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EPHA1P21709 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EPHA1P21709 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
EPHA1P21709 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EPHA1P21709 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EPHA1P21709 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EPHA1P21709 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EPHA1P21709 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EPHA1P21709 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EPHA1P21709 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EPHA1P21709 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EPHA1P21709 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EPHA1P21709 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EPHA1P21709 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPHA1P21709 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPHA1P21709 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPHA1P21709 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPHA1P21709 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPHA1P21709 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPHA1P21709 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
EPHA1P21709 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPHA1P21709 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPHA1P21709 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EPHA1P21709 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EPHA1P21709 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EPHA1P21709 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPHA1P21709 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPHA1P21709 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPHA1P21709 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPHA1P21709 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPHA1P21709 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPHA1P21709 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPHA1P21709 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPHA1P21709 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms