Protein–RNA interactions for Protein: P13611

VCAN, Versican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCANP13611 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
VCANP13611 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VCANP13611 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VCANP13611 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
VCANP13611 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VCANP13611 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
VCANP13611 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VCANP13611 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VCANP13611 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VCANP13611 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
VCANP13611 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VCANP13611 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VCANP13611 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
VCANP13611 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VCANP13611 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
VCANP13611 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
VCANP13611 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VCANP13611 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
VCANP13611 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
VCANP13611 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
VCANP13611 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
VCANP13611 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
VCANP13611 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VCANP13611 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VCANP13611 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
VCANP13611 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
VCANP13611 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
VCANP13611 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
VCANP13611 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VCANP13611 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
VCANP13611 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VCANP13611 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VCANP13611 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VCANP13611 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VCANP13611 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VCANP13611 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
VCANP13611 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
VCANP13611 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
VCANP13611 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
VCANP13611 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VCANP13611 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
VCANP13611 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
VCANP13611 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
VCANP13611 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
VCANP13611 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
VCANP13611 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
VCANP13611 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
VCANP13611 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VCANP13611 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VCANP13611 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VCANP13611 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
VCANP13611 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
VCANP13611 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
VCANP13611 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VCANP13611 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VCANP13611 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
VCANP13611 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
VCANP13611 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
VCANP13611 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
VCANP13611 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
VCANP13611 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
VCANP13611 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
VCANP13611 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
VCANP13611 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
VCANP13611 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
VCANP13611 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VCANP13611 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VCANP13611 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
VCANP13611 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
VCANP13611 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
VCANP13611 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VCANP13611 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VCANP13611 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VCANP13611 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VCANP13611 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VCANP13611 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VCANP13611 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VCANP13611 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VCANP13611 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
VCANP13611 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VCANP13611 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VCANP13611 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VCANP13611 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VCANP13611 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VCANP13611 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VCANP13611 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VCANP13611 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VCANP13611 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VCANP13611 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VCANP13611 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VCANP13611 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VCANP13611 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
VCANP13611 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VCANP13611 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
VCANP13611 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
VCANP13611 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
VCANP13611 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VCANP13611 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VCANP13611 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
VCANP13611 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms