Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GP1BBP13224 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GP1BBP13224 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GP1BBP13224 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GP1BBP13224 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GP1BBP13224 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GP1BBP13224 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
GP1BBP13224 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GP1BBP13224 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GP1BBP13224 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GP1BBP13224 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GP1BBP13224 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GP1BBP13224 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GP1BBP13224 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GP1BBP13224 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GP1BBP13224 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GP1BBP13224 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GP1BBP13224 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GP1BBP13224 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GP1BBP13224 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GP1BBP13224 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GP1BBP13224 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GP1BBP13224 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GP1BBP13224 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GP1BBP13224 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GP1BBP13224 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GP1BBP13224 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GP1BBP13224 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GP1BBP13224 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GP1BBP13224 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GP1BBP13224 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GP1BBP13224 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GP1BBP13224 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GP1BBP13224 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GP1BBP13224 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GP1BBP13224 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GP1BBP13224 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GP1BBP13224 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GP1BBP13224 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GP1BBP13224 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GP1BBP13224 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GP1BBP13224 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GP1BBP13224 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GP1BBP13224 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GP1BBP13224 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GP1BBP13224 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GP1BBP13224 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GP1BBP13224 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GP1BBP13224 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GP1BBP13224 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GP1BBP13224 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GP1BBP13224 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GP1BBP13224 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GP1BBP13224 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GP1BBP13224 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GP1BBP13224 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GP1BBP13224 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GP1BBP13224 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GP1BBP13224 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GP1BBP13224 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GP1BBP13224 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GP1BBP13224 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GP1BBP13224 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GP1BBP13224 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GP1BBP13224 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GP1BBP13224 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GP1BBP13224 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GP1BBP13224 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GP1BBP13224 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GP1BBP13224 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GP1BBP13224 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GP1BBP13224 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GP1BBP13224 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GP1BBP13224 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GP1BBP13224 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GP1BBP13224 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GP1BBP13224 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GP1BBP13224 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GP1BBP13224 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GP1BBP13224 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GP1BBP13224 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GP1BBP13224 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GP1BBP13224 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GP1BBP13224 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GP1BBP13224 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GP1BBP13224 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GP1BBP13224 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GP1BBP13224 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GP1BBP13224 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GP1BBP13224 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GP1BBP13224 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GP1BBP13224 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GP1BBP13224 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GP1BBP13224 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GP1BBP13224 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GP1BBP13224 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GP1BBP13224 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GP1BBP13224 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GP1BBP13224 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GP1BBP13224 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.8 ms