Protein–RNA interactions for Protein: P12955

PEPD, Xaa-Pro dipeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEPDP12955 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PEPDP12955 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PEPDP12955 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PEPDP12955 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PEPDP12955 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PEPDP12955 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PEPDP12955 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PEPDP12955 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PEPDP12955 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PEPDP12955 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PEPDP12955 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PEPDP12955 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PEPDP12955 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PEPDP12955 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PEPDP12955 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PEPDP12955 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PEPDP12955 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PEPDP12955 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PEPDP12955 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PEPDP12955 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PEPDP12955 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PEPDP12955 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PEPDP12955 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PEPDP12955 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PEPDP12955 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PEPDP12955 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PEPDP12955 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PEPDP12955 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PEPDP12955 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PEPDP12955 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PEPDP12955 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PEPDP12955 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PEPDP12955 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PEPDP12955 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PEPDP12955 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PEPDP12955 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PEPDP12955 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PEPDP12955 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PEPDP12955 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PEPDP12955 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PEPDP12955 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PEPDP12955 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PEPDP12955 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PEPDP12955 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PEPDP12955 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PEPDP12955 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PEPDP12955 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PEPDP12955 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PEPDP12955 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PEPDP12955 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PEPDP12955 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PEPDP12955 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PEPDP12955 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PEPDP12955 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PEPDP12955 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PEPDP12955 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PEPDP12955 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PEPDP12955 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PEPDP12955 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PEPDP12955 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PEPDP12955 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PEPDP12955 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PEPDP12955 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PEPDP12955 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PEPDP12955 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PEPDP12955 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PEPDP12955 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PEPDP12955 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PEPDP12955 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PEPDP12955 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PEPDP12955 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PEPDP12955 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PEPDP12955 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PEPDP12955 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PEPDP12955 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PEPDP12955 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PEPDP12955 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PEPDP12955 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PEPDP12955 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PEPDP12955 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PEPDP12955 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PEPDP12955 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PEPDP12955 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PEPDP12955 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PEPDP12955 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PEPDP12955 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PEPDP12955 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PEPDP12955 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PEPDP12955 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PEPDP12955 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PEPDP12955 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PEPDP12955 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PEPDP12955 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PEPDP12955 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PEPDP12955 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PEPDP12955 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PEPDP12955 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PEPDP12955 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PEPDP12955 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PEPDP12955 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms