Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
GLI3P10071 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
GLI3P10071 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
GLI3P10071 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
GLI3P10071 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
GLI3P10071 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
GLI3P10071 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
GLI3P10071 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
GLI3P10071 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
GLI3P10071 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
GLI3P10071 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
GLI3P10071 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
GLI3P10071 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
GLI3P10071 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
GLI3P10071 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
GLI3P10071 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
GLI3P10071 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
GLI3P10071 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
GLI3P10071 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
GLI3P10071 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC34.76■■■■□ 3.16
GLI3P10071 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
GLI3P10071 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
GLI3P10071 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
GLI3P10071 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
GLI3P10071 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
GLI3P10071 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
GLI3P10071 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
GLI3P10071 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
GLI3P10071 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
GLI3P10071 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
GLI3P10071 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
GLI3P10071 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
GLI3P10071 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
GLI3P10071 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC34.73■■■■□ 3.15
GLI3P10071 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
GLI3P10071 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
GLI3P10071 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
GLI3P10071 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
GLI3P10071 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
GLI3P10071 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.7■■■■□ 3.14
GLI3P10071 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
GLI3P10071 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
GLI3P10071 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
GLI3P10071 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
GLI3P10071 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
GLI3P10071 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
GLI3P10071 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
GLI3P10071 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
GLI3P10071 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
GLI3P10071 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
GLI3P10071 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
GLI3P10071 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
GLI3P10071 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
GLI3P10071 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC34.62■■■■□ 3.13
GLI3P10071 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
GLI3P10071 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
GLI3P10071 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
GLI3P10071 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC34.61■■■■□ 3.13
GLI3P10071 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
GLI3P10071 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
GLI3P10071 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
GLI3P10071 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
GLI3P10071 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
GLI3P10071 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
GLI3P10071 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
GLI3P10071 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
GLI3P10071 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
GLI3P10071 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
GLI3P10071 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
GLI3P10071 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
GLI3P10071 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
GLI3P10071 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
GLI3P10071 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
GLI3P10071 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC34.55■■■■□ 3.12
GLI3P10071 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
GLI3P10071 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
GLI3P10071 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
GLI3P10071 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
GLI3P10071 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
GLI3P10071 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
GLI3P10071 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
GLI3P10071 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
GLI3P10071 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
GLI3P10071 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
GLI3P10071 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
GLI3P10071 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
GLI3P10071 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
GLI3P10071 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
GLI3P10071 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
GLI3P10071 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
GLI3P10071 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
GLI3P10071 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
GLI3P10071 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
GLI3P10071 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
GLI3P10071 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
GLI3P10071 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
GLI3P10071 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
GLI3P10071 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
GLI3P10071 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC34.46■■■■□ 3.11
GLI3P10071 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms