Protein–RNA interactions for Protein: P01563

IFNA2, Interferon alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA2P01563 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFNA2P01563 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFNA2P01563 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFNA2P01563 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFNA2P01563 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFNA2P01563 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFNA2P01563 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFNA2P01563 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
IFNA2P01563 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFNA2P01563 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFNA2P01563 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNA2P01563 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNA2P01563 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNA2P01563 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNA2P01563 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNA2P01563 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNA2P01563 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFNA2P01563 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IFNA2P01563 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFNA2P01563 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFNA2P01563 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFNA2P01563 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFNA2P01563 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22■■□□□ 1.11
IFNA2P01563 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNA2P01563 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNA2P01563 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNA2P01563 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNA2P01563 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNA2P01563 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNA2P01563 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNA2P01563 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFNA2P01563 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
IFNA2P01563 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFNA2P01563 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFNA2P01563 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFNA2P01563 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFNA2P01563 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFNA2P01563 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFNA2P01563 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFNA2P01563 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFNA2P01563 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFNA2P01563 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFNA2P01563 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
IFNA2P01563 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFNA2P01563 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFNA2P01563 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFNA2P01563 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFNA2P01563 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFNA2P01563 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IFNA2P01563 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IFNA2P01563 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
IFNA2P01563 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFNA2P01563 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFNA2P01563 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFNA2P01563 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFNA2P01563 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFNA2P01563 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFNA2P01563 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IFNA2P01563 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IFNA2P01563 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IFNA2P01563 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IFNA2P01563 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IFNA2P01563 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IFNA2P01563 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IFNA2P01563 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IFNA2P01563 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IFNA2P01563 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IFNA2P01563 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IFNA2P01563 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IFNA2P01563 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFNA2P01563 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFNA2P01563 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFNA2P01563 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFNA2P01563 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFNA2P01563 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFNA2P01563 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFNA2P01563 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFNA2P01563 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFNA2P01563 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFNA2P01563 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFNA2P01563 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFNA2P01563 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFNA2P01563 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFNA2P01563 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFNA2P01563 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFNA2P01563 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFNA2P01563 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IFNA2P01563 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IFNA2P01563 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IFNA2P01563 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
IFNA2P01563 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IFNA2P01563 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IFNA2P01563 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IFNA2P01563 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IFNA2P01563 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFNA2P01563 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFNA2P01563 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFNA2P01563 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFNA2P01563 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFNA2P01563 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms