Protein–RNA interactions for Protein: O75695

RP2, Protein XRP2, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RP2O75695 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RP2O75695 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RP2O75695 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RP2O75695 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RP2O75695 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RP2O75695 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RP2O75695 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RP2O75695 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RP2O75695 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RP2O75695 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RP2O75695 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RP2O75695 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RP2O75695 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RP2O75695 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RP2O75695 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RP2O75695 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RP2O75695 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RP2O75695 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RP2O75695 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RP2O75695 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RP2O75695 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RP2O75695 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RP2O75695 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RP2O75695 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RP2O75695 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RP2O75695 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RP2O75695 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RP2O75695 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RP2O75695 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RP2O75695 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RP2O75695 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RP2O75695 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RP2O75695 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RP2O75695 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RP2O75695 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RP2O75695 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RP2O75695 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RP2O75695 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RP2O75695 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RP2O75695 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RP2O75695 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RP2O75695 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RP2O75695 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RP2O75695 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RP2O75695 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RP2O75695 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RP2O75695 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RP2O75695 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RP2O75695 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RP2O75695 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RP2O75695 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RP2O75695 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RP2O75695 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RP2O75695 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RP2O75695 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RP2O75695 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RP2O75695 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RP2O75695 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RP2O75695 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RP2O75695 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RP2O75695 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RP2O75695 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RP2O75695 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RP2O75695 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RP2O75695 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RP2O75695 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RP2O75695 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RP2O75695 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RP2O75695 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RP2O75695 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RP2O75695 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RP2O75695 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RP2O75695 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RP2O75695 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RP2O75695 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RP2O75695 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RP2O75695 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RP2O75695 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RP2O75695 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RP2O75695 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RP2O75695 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RP2O75695 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RP2O75695 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RP2O75695 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RP2O75695 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RP2O75695 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RP2O75695 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RP2O75695 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RP2O75695 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RP2O75695 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RP2O75695 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RP2O75695 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RP2O75695 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RP2O75695 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RP2O75695 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RP2O75695 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RP2O75695 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RP2O75695 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RP2O75695 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RP2O75695 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms