Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTNSO60931 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTNSO60931 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTNSO60931 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTNSO60931 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTNSO60931 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTNSO60931 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTNSO60931 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTNSO60931 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTNSO60931 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTNSO60931 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTNSO60931 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTNSO60931 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTNSO60931 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CTNSO60931 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTNSO60931 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTNSO60931 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CTNSO60931 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTNSO60931 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTNSO60931 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTNSO60931 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTNSO60931 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTNSO60931 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTNSO60931 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CTNSO60931 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CTNSO60931 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CTNSO60931 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTNSO60931 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTNSO60931 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTNSO60931 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTNSO60931 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CTNSO60931 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
CTNSO60931 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTNSO60931 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTNSO60931 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTNSO60931 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTNSO60931 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTNSO60931 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTNSO60931 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTNSO60931 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTNSO60931 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTNSO60931 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTNSO60931 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTNSO60931 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTNSO60931 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTNSO60931 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTNSO60931 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTNSO60931 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTNSO60931 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CTNSO60931 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CTNSO60931 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CTNSO60931 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CTNSO60931 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CTNSO60931 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CTNSO60931 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CTNSO60931 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CTNSO60931 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CTNSO60931 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTNSO60931 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CTNSO60931 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTNSO60931 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTNSO60931 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTNSO60931 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTNSO60931 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTNSO60931 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTNSO60931 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTNSO60931 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTNSO60931 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CTNSO60931 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTNSO60931 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CTNSO60931 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CTNSO60931 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
CTNSO60931 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTNSO60931 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTNSO60931 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTNSO60931 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTNSO60931 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTNSO60931 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTNSO60931 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTNSO60931 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTNSO60931 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTNSO60931 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTNSO60931 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTNSO60931 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTNSO60931 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTNSO60931 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTNSO60931 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTNSO60931 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTNSO60931 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTNSO60931 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTNSO60931 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTNSO60931 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTNSO60931 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTNSO60931 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTNSO60931 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTNSO60931 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTNSO60931 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTNSO60931 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTNSO60931 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTNSO60931 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms