Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
PPLO60437 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
PPLO60437 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.53
PPLO60437 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
PPLO60437 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
PPLO60437 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
PPLO60437 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
PPLO60437 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
PPLO60437 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
PPLO60437 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
PPLO60437 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
PPLO60437 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
PPLO60437 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
PPLO60437 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
PPLO60437 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC37.02■■■■□ 3.52
PPLO60437 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.52
PPLO60437 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
PPLO60437 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC37.01■■■■□ 3.51
PPLO60437 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
PPLO60437 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
PPLO60437 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
PPLO60437 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
PPLO60437 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
PPLO60437 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
PPLO60437 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.97■■■■□ 3.51
PPLO60437 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.96■■■■□ 3.51
PPLO60437 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
PPLO60437 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
PPLO60437 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
PPLO60437 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
PPLO60437 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
PPLO60437 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
PPLO60437 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
PPLO60437 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
PPLO60437 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
PPLO60437 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
PPLO60437 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
PPLO60437 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC36.91■■■■□ 3.5
PPLO60437 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
PPLO60437 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
PPLO60437 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
PPLO60437 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
PPLO60437 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC36.91■■■■□ 3.5
PPLO60437 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
PPLO60437 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
PPLO60437 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
PPLO60437 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
PPLO60437 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
PPLO60437 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
PPLO60437 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
PPLO60437 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC36.89■■■■□ 3.5
PPLO60437 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC36.89■■■■□ 3.5
PPLO60437 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
PPLO60437 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
PPLO60437 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
PPLO60437 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
PPLO60437 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
PPLO60437 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
PPLO60437 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC36.86■■■■□ 3.49
PPLO60437 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
PPLO60437 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
PPLO60437 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
PPLO60437 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC36.86■■■■□ 3.49
PPLO60437 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
PPLO60437 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
PPLO60437 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
PPLO60437 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
PPLO60437 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
PPLO60437 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
PPLO60437 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
PPLO60437 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC36.83■■■■□ 3.49
PPLO60437 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
PPLO60437 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
PPLO60437 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
PPLO60437 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
PPLO60437 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
PPLO60437 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
PPLO60437 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
PPLO60437 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
PPLO60437 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
PPLO60437 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
PPLO60437 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
PPLO60437 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
PPLO60437 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
PPLO60437 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
PPLO60437 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
PPLO60437 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
PPLO60437 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
PPLO60437 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
PPLO60437 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
PPLO60437 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC36.75■■■■□ 3.47
PPLO60437 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
PPLO60437 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
PPLO60437 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
PPLO60437 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
PPLO60437 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC36.74■■■■□ 3.47
PPLO60437 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
PPLO60437 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
PPLO60437 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
PPLO60437 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.6 ms